RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIPC1-205	ENST00000586027	GOLGA2	Q08379	1002 aa		40.79	■■■■■ 4.12
GIPC1-205	ENST00000586027	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	40.79	■■■■■ 4.12
GIPC1-205	ENST00000586027	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	40.78	■■■■■ 4.12
GIPC1-205	ENST00000586027	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		40.78	■■■■■ 4.12
GIPC1-205	ENST00000586027	STARD3NL	O95772	234 aa		40.77	■■■■■ 4.12
GIPC1-205	ENST00000586027	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	40.77	■■■■■ 4.12
GIPC1-205	ENST00000586027	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		40.77	■■■■■ 4.12
GIPC1-205	ENST00000586027	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		40.77	■■■■■ 4.12
GIPC1-205	ENST00000586027	GNPAT	O15228	680 aa		40.76	■■■■■ 4.12
GIPC1-205	ENST00000586027	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		40.76	■■■■■ 4.12
GIPC1-205	ENST00000586027	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		40.75	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		40.75	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027	A1BG	P04217	495 aa		40.74	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		40.74	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		40.74	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		40.73	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		40.73	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	40.73	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		40.73	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027	SLFN5	Q08AF3	891 aa		40.72	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027	TSPYL6	Q8N831	410 aa		40.72	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	40.71	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	40.71	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027		E9PSI1	815 aa		40.7	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027	RPS6KA4	O75676	772 aa		40.7	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027	PHF14	O94880	888 aa		40.7	■■■■■ 4.11
GIPC1-205	ENST00000586027	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	40.68	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		40.68	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		40.68	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	40.66	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	NBPF26	B4DH59	902 aa		40.66	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	HOXB7	P09629	217 aa		40.66	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	40.66	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	40.66	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	40.66	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	NBPF15	Q8N660	670 aa		40.66	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	SSFA2	P28290	1259 aa		40.65	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	40.65	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	NECTIN2	Q92692	538 aa		40.65	■■■■■ 4.1
GIPC1-205	ENST00000586027	CASZ1	Q86V15	1759 aa		40.62	■■■■■ 4.09
GIPC1-205	ENST00000586027	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
GIPC1-205	ENST00000586027	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	40.61	■■■■■ 4.09
GIPC1-205	ENST00000586027	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		40.61	■■■■■ 4.09
GIPC1-205	ENST00000586027	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	40.6	■■■■■ 4.09
GIPC1-205	ENST00000586027	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
GIPC1-205	ENST00000586027	PDIA6	Q15084	440 aa		40.59	■■■■■ 4.09
GIPC1-205	ENST00000586027	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		40.59	■■■■■ 4.09
GIPC1-205	ENST00000586027	COL15A1	P39059	1388 aa		40.58	■■■■■ 4.09
GIPC1-205	ENST00000586027	PROSER3	Q2NL68	480 aa		40.58	■■■■■ 4.09
GIPC1-205	ENST00000586027	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		40.58	■■■■■ 4.09
GIPC1-205	ENST00000586027	ADRA2B	P18089	450 aa		40.57	■■■■■ 4.08
GIPC1-205	ENST00000586027	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.08
GIPC1-205	ENST00000586027	MSH5	O43196	834 aa		40.56	■■■■■ 4.08
GIPC1-205	ENST00000586027	ANXA1	P04083	346 aa		40.56	■■■■■ 4.08
GIPC1-205	ENST00000586027	ERBB4	Q15303	1308 aa		40.55	■■■■■ 4.08
GIPC1-205	ENST00000586027	C4A	P0C0L4	1744 aa		40.55	■■■■■ 4.08
GIPC1-205	ENST00000586027	VAMP4	O75379	141 aa		40.54	■■■■■ 4.08
GIPC1-205	ENST00000586027	MYL6B	P14649	208 aa		40.54	■■■■■ 4.08
GIPC1-205	ENST00000586027	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		40.54	■■■■■ 4.08
GIPC1-205	ENST00000586027	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		40.54	■■■■■ 4.08
GIPC1-205	ENST00000586027	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	40.53	■■■■■ 4.08
GIPC1-205	ENST00000586027	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
GIPC1-205	ENST00000586027	RFC4	P35249	363 aa		40.49	■■■■■ 4.07
GIPC1-205	ENST00000586027	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	40.49	■■■■■ 4.07
GIPC1-205	ENST00000586027	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	40.48	■■■■■ 4.07
GIPC1-205	ENST00000586027	ZBTB7A	O95365	584 aa		40.48	■■■■■ 4.07
GIPC1-205	ENST00000586027	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		40.48	■■■■■ 4.07
GIPC1-205	ENST00000586027	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	40.47	■■■■■ 4.07
GIPC1-205	ENST00000586027	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
GIPC1-205	ENST00000586027	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		40.46	■■■■■ 4.07
GIPC1-205	ENST00000586027		A0A087WZG4	1122 aa		40.45	■■■■■ 4.07
GIPC1-205	ENST00000586027	NARF	Q9UHQ1	456 aa		40.45	■■■■■ 4.07
GIPC1-205	ENST00000586027	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	40.44	■■■■■ 4.06
GIPC1-205	ENST00000586027	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		40.44	■■■■■ 4.06
GIPC1-205	ENST00000586027	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		40.43	■■■■■ 4.06
GIPC1-205	ENST00000586027	MSL1	Q68DK7	614 aa		40.43	■■■■■ 4.06
GIPC1-205	ENST00000586027	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		40.43	■■■■■ 4.06
GIPC1-205	ENST00000586027	GYS1	P13807	737 aa		40.42	■■■■■ 4.06
GIPC1-205	ENST00000586027	ARX	Q96QS3	562 aa		40.42	■■■■■ 4.06
GIPC1-205	ENST00000586027	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	40.41	■■■■■ 4.06
GIPC1-205	ENST00000586027	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		40.41	■■■■■ 4.06
GIPC1-205	ENST00000586027	CAMTA2	O94983	1202 aa		40.4	■■■■■ 4.06
GIPC1-205	ENST00000586027	MTFR1L	Q9H019	292 aa		40.4	■■■■■ 4.06
GIPC1-205	ENST00000586027	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	40.4	■■■■■ 4.06
GIPC1-205	ENST00000586027	ZPR1	O75312	459 aa		40.39	■■■■■ 4.06
GIPC1-205	ENST00000586027	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		40.39	■■■■■ 4.06
GIPC1-205	ENST00000586027	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		40.38	■■■■■ 4.06
GIPC1-205	ENST00000586027	COPS6	Q7L5N1	327 aa		40.37	■■■■■ 4.05
GIPC1-205	ENST00000586027	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	40.37	■■■■■ 4.05
GIPC1-205	ENST00000586027	HYPK	Q9NX55	129 aa		40.37	■■■■■ 4.05
GIPC1-205	ENST00000586027	SCN7A	Q01118	1682 aa		40.37	■■■■■ 4.05
GIPC1-205	ENST00000586027	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	40.36	■■■■■ 4.05
GIPC1-205	ENST00000586027	FKBP8	Q14318	412 aa		40.36	■■■■■ 4.05
GIPC1-205	ENST00000586027	STK31	Q9BXU1	1019 aa		40.35	■■■■■ 4.05
GIPC1-205	ENST00000586027	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		40.34	■■■■■ 4.05
GIPC1-205	ENST00000586027	SLC4A2	P04920	1241 aa		40.34	■■■■■ 4.05
GIPC1-205	ENST00000586027	G2E3	Q7L622	706 aa		40.33	■■■■■ 4.05

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