RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582246.1

SKAP1-AS1-201, SKAP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SKAP1-AS1, Length 687 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 UTRNP46939 3433 aa16.12■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 HEG1Q9ULI3 1381 aa16.12■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 KCNQ3O43525 872 aa16.11■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.11■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CCDC87Q9NVE4 849 aa16.11■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 FMNL2Q96PY5 1086 aa16.1■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 LAMB4A4D0S4 1761 aa16.09■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 RFC4P35249 363 aa16.09■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 FKBP8Q14318 412 aa16.09■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SYT17Q9BSW7 474 aa16.09■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ADAMTS8Q9UP79 889 aa16.09■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16.09■□□□□ 0.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 TMPOP42166 694 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 RIPK4P57078 832 aa16.07■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 RUNDC1Q96C34 613 aa16.07■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.07■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 COL15A1P39059 1388 aa16.07■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ANP32CO43423 234 aa16.06■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 STARD3NLO95772 234 aa16.06■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 GYS1P13807 737 aa16.06■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CCDC184Q52MB2 194 aa16.06■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SCN7AQ01118 1682 aa16.05■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NEUROD2Q15784 382 aa16.05■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa16.04■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 MMP10P09238 476 aa16.04■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.04■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NLGN2Q8NFZ4 835 aa16.04■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.03■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 KIF13BQ9NQT8 1826 aa16.03■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 A1BGP04217 495 aa16.02■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 BCORQ6W2J9 1755 aa16.02■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ZPR1O75312 459 aa16.01■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 EIF5P55010 431 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.01■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 MRS2Q9HD23 443 aa16.01■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 USP16Q9Y5T5 823 aa16.01■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NARFQ9UHQ1 456 aa16■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CD2APQ9Y5K6 639 aa16■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.99■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 C10orf71Q711Q0 1435 aa15.99■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 APAF1O14727 1248 aa15.98■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 DDR1Q08345 913 aa15.98■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 PARP3Q9Y6F1 533 aa15.98■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 A0A087WZG4 1122 aa15.97■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 BCL2L12Q9HB09 334 aa15.97■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.96■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.96■□□□□ 0.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 PXDNLA1KZ92 1463 aa15.96■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CHD4Q14839 1912 aa15.96■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NBPF26B4DH59 902 aa15.95■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NFIXQ14938 502 aa15.95■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 GPR162Q16538 588 aa15.95■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NBPF15Q8N660 670 aa15.95■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.95■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.94■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CHL1O00533 1208 aa15.93■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 TM4SF1P30408 202 aa15.93■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 BICDL1Q6ZP65 573 aa15.93■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.93■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CAMTA2O94983 1202 aa15.92■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 KRT24Q2M2I5 525 aa15.91■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 TBC1D9BQ66K14 1250 aa15.91■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NUP98P52948 1817 aa15.9■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CFAP44Q96MT7 982 aa15.9■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa15.9■□□□□ 0.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.89■□□□□ 0.13
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SERPINB2P05120 415 aa15.89■□□□□ 0.13
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 MYL6BP14649 208 aa15.89■□□□□ 0.13
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms