RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568721.1

KCTD13-208, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 13, human

TSL 2

Gene KCTD13, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCTD13-208	ENST00000568721	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
KCTD13-208	ENST00000568721	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
KCTD13-208	ENST00000568721	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
KCTD13-208	ENST00000568721	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		29.1	■■■□□ 2.25
KCTD13-208	ENST00000568721	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		29.1	■■■□□ 2.25
KCTD13-208	ENST00000568721	USP16	Q9Y5T5	823 aa		29.1	■■■□□ 2.25
KCTD13-208	ENST00000568721	STARD3NL	O95772	234 aa		29.09	■■■□□ 2.25
KCTD13-208	ENST00000568721	RFC4	P35249	363 aa		29.09	■■■□□ 2.25
KCTD13-208	ENST00000568721	GYS1	P13807	737 aa		29.08	■■■□□ 2.25
KCTD13-208	ENST00000568721	NEUROD2	Q15784	382 aa		29.08	■■■□□ 2.25
KCTD13-208	ENST00000568721	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
KCTD13-208	ENST00000568721	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
KCTD13-208	ENST00000568721	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
KCTD13-208	ENST00000568721	A1BG	P04217	495 aa		29.05	■■■□□ 2.24
KCTD13-208	ENST00000568721	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
KCTD13-208	ENST00000568721	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
KCTD13-208	ENST00000568721	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		29.05	■■■□□ 2.24
KCTD13-208	ENST00000568721	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		29.04	■■■□□ 2.24
KCTD13-208	ENST00000568721	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
KCTD13-208	ENST00000568721	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
KCTD13-208	ENST00000568721	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		29.04	■■■□□ 2.24
KCTD13-208	ENST00000568721	COL15A1	P39059	1388 aa		29.03	■■■□□ 2.24
KCTD13-208	ENST00000568721	APAF1	O14727	1248 aa		29.03	■■■□□ 2.24
KCTD13-208	ENST00000568721	MRS2	Q9HD23	443 aa		29.03	■■■□□ 2.24
KCTD13-208	ENST00000568721	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		29	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	MMP10	P09238	476 aa		29	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	FKBP8	Q14318	412 aa		29	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		29	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	NARF	Q9UHQ1	456 aa		29	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		28.99	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		28.98	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		28.98	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.97	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		28.97	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	NBPF26	B4DH59	902 aa		28.96	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	CHL1	O00533	1208 aa		28.96	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	ZPR1	O75312	459 aa		28.96	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	TM4SF1	P30408	202 aa		28.96	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	NBPF15	Q8N660	670 aa		28.96	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		28.96	■■■□□ 2.23
KCTD13-208	ENST00000568721	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
KCTD13-208	ENST00000568721	SCN7A	Q01118	1682 aa		28.93	■■■□□ 2.22
KCTD13-208	ENST00000568721	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		28.93	■■■□□ 2.22
KCTD13-208	ENST00000568721	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		28.93	■■■□□ 2.22
KCTD13-208	ENST00000568721		A0A087WZG4	1122 aa		28.92	■■■□□ 2.22
KCTD13-208	ENST00000568721	DDR1	Q08345	913 aa		28.92	■■■□□ 2.22
KCTD13-208	ENST00000568721	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		28.91	■■■□□ 2.22
KCTD13-208	ENST00000568721	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		28.9	■■■□□ 2.22
KCTD13-208	ENST00000568721	ZNF853	P0CG23	659 aa		28.89	■■■□□ 2.22
KCTD13-208	ENST00000568721	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
KCTD13-208	ENST00000568721	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		28.89	■■■□□ 2.22
KCTD13-208	ENST00000568721	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
KCTD13-208	ENST00000568721	CAMTA2	O94983	1202 aa		28.88	■■■□□ 2.21
KCTD13-208	ENST00000568721	NFIX	Q14938	502 aa		28.88	■■■□□ 2.21
KCTD13-208	ENST00000568721	CFAP44	Q96MT7	982 aa		28.88	■■■□□ 2.21
KCTD13-208	ENST00000568721	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
KCTD13-208	ENST00000568721	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
KCTD13-208	ENST00000568721	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		28.86	■■■□□ 2.21
KCTD13-208	ENST00000568721	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		28.86	■■■□□ 2.21
KCTD13-208	ENST00000568721	KRT24	Q2M2I5	525 aa		28.86	■■■□□ 2.21
KCTD13-208	ENST00000568721	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
KCTD13-208	ENST00000568721	CCDC27	Q2M243	656 aa		28.84	■■■□□ 2.21
KCTD13-208	ENST00000568721	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
KCTD13-208	ENST00000568721	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		28.83	■■■□□ 2.21
KCTD13-208	ENST00000568721	MBIP	Q9NS73	344 aa		28.83	■■■□□ 2.21
KCTD13-208	ENST00000568721	NUP98	P52948	1817 aa		28.83	■■■□□ 2.21
KCTD13-208	ENST00000568721	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	CHD4	Q14839	1912 aa		28.81	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		28.81	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	PDIA6	Q15084	440 aa		28.81	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		28.81	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	WWC1	Q8IX03	1113 aa		28.81	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		28.81	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	IFT57	Q9NWB7	429 aa		28.81	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		28.8	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	UTRN	P46939	3433 aa		28.8	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	ERBB4	Q15303	1308 aa		28.8	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	SERPINB2	P05120	415 aa		28.79	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	TGFB2	P61812	414 aa		28.79	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	28.78	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	GNAI1	P63096	354 aa		28.78	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		28.78	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		28.78	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	GPR162	Q16538	588 aa		28.77	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		28.76	■■■□□ 2.2
KCTD13-208	ENST00000568721	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
KCTD13-208	ENST00000568721	RGL2	O15211	777 aa		28.76	■■■□□ 2.19
KCTD13-208	ENST00000568721	MYL6B	P14649	208 aa		28.76	■■■□□ 2.19
KCTD13-208	ENST00000568721	PROSER3	Q2NL68	480 aa		28.76	■■■□□ 2.19
KCTD13-208	ENST00000568721	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		28.76	■■■□□ 2.19
KCTD13-208	ENST00000568721	NGEF	Q8N5V2	710 aa		28.76	■■■□□ 2.19
KCTD13-208	ENST00000568721		A0A0G2JLW4	131 aa		28.75	■■■□□ 2.19
KCTD13-208	ENST00000568721	HLF	Q16534	295 aa		28.75	■■■□□ 2.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms