RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
USP10-208ENST00000563386 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
USP10-208ENST00000563386 RUNDC1Q96C34 613 aa24.92■■□□□ 1.58
USP10-208ENST00000563386 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
USP10-208ENST00000563386 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.92■■□□□ 1.58
USP10-208ENST00000563386 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
USP10-208ENST00000563386 C4AP0C0L4 1744 aa24.89■■□□□ 1.58
USP10-208ENST00000563386 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
USP10-208ENST00000563386 MMP10P09238 476 aa24.89■■□□□ 1.58
USP10-208ENST00000563386 GYS1P13807 737 aa24.89■■□□□ 1.58
USP10-208ENST00000563386 CCDC184Q52MB2 194 aa24.89■■□□□ 1.58
USP10-208ENST00000563386 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.89■■□□□ 1.58
USP10-208ENST00000563386 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
USP10-208ENST00000563386 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.87■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 ZPR1O75312 459 aa24.87■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.87■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 COL15A1P39059 1388 aa24.86■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 A1BGP04217 495 aa24.86■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.86■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 USP16Q9Y5T5 823 aa24.86■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 FKBP8Q14318 412 aa24.84■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.84■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 MRS2Q9HD23 443 aa24.83■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.83■■□□□ 1.57
USP10-208ENST00000563386 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
USP10-208ENST00000563386 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.82■■□□□ 1.56
USP10-208ENST00000563386 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.82■■□□□ 1.56
USP10-208ENST00000563386 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
USP10-208ENST00000563386 GPR162Q16538 588 aa24.81■■□□□ 1.56
USP10-208ENST00000563386 NARFQ9UHQ1 456 aa24.81■■□□□ 1.56
USP10-208ENST00000563386 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.8■■□□□ 1.56
USP10-208ENST00000563386 A0A087WZG4 1122 aa24.8■■□□□ 1.56
USP10-208ENST00000563386 APAF1O14727 1248 aa24.8■■□□□ 1.56
USP10-208ENST00000563386 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
USP10-208ENST00000563386 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
USP10-208ENST00000563386 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.79■■□□□ 1.56
USP10-208ENST00000563386 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.79■■□□□ 1.56
USP10-208ENST00000563386 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
USP10-208ENST00000563386 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.76■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.76■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 DDR1Q08345 913 aa24.75■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.75■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.75■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 NBPF26B4DH59 902 aa24.73■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 TM4SF1P30408 202 aa24.73■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 NFIXQ14938 502 aa24.73■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 NBPF15Q8N660 670 aa24.73■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 NGEFQ8N5V2 710 aa24.71■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.71■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.7■■□□□ 1.55
USP10-208ENST00000563386 CHL1O00533 1208 aa24.69■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.69■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 A0A0G2JLW4 131 aa24.68■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 CAMTA2O94983 1202 aa24.68■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 MYL6BP14649 208 aa24.68■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.68■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 SERPINB2P05120 415 aa24.67■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 SCN7AQ01118 1682 aa24.66■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 YY1P25490 414 aa24.66■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 TGFB2P61812 414 aa24.66■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.66■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 NECTIN2Q92692 538 aa24.66■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 DPEP1P16444 411 aa24.65■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 KRT24Q2M2I5 525 aa24.65■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.64■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.64■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 CFAP44Q96MT7 982 aa24.64■■□□□ 1.54
USP10-208ENST00000563386 SETDB2Q96T68 719 aa24.63■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.63■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 GRIN3BO60391 1043 aa24.62■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 MBIPQ9NS73 344 aa24.62■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 NPHP1O15259 732 aa24.61■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 GNAI1P63096 354 aa24.61■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 BCORQ6W2J9 1755 aa24.61■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.6■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 ANXA1P04083 346 aa24.6■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 CHRNA5P30532 468 aa24.6■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.6■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.6■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.6■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 IFT57Q9NWB7 429 aa24.6■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 BCS1LQ9Y276 419 aa24.6■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.6■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 HLFQ16534 295 aa24.59■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 ERBB4Q15303 1308 aa24.59■■□□□ 1.53
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