RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561105.1

PDE8A-215, Transcript of phosphodiesterase 8A, human

TSL 2

Gene PDE8A, Length 191 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE8A-215	ENST00000561105	ZNF787	Q6DD87	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	NBPF15	Q8N660	670 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	TRIM47	Q96LD4	638 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	SERTM1	A2A2V5	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	SSFA2	P28290	1259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	TXLNA	P40222	546 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	PLA2G4A	P47712	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	PTS	Q03393	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	TEAD4	Q15561	434 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	NGLY1	Q96IV0	654 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	IGFBP4	P22692	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	KIFC2	Q96AC6	838 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	KLRG1	Q96E93	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	GPAM	Q9HCL2	828 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	UST	Q9Y2C2	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	EML1	O00423	815 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	MSX1	P28360	303 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	VEGFB	P49765	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	PDE4C	Q08493	712 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	SLC35F4	A4IF30	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	WDR44	Q5JSH3	913 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	RUBCNL	Q9H714	662 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	PPFIA3	O75145	1194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	F11	P03951	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	DBN1	Q16643	649 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	ZIC5	Q96T25	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105		A0A1W2PNR3	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	FOXO3	O43524	673 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	COX20	Q5RI15	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	KLK14	Q9P0G3	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105		A0A1B0GTH6	734 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	BRD1	O95696	1058 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	ABL1	P00519	1130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	MTMR3	Q13615	1198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	ATP4A	P20648	1035 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	SERPINB4	P48594	390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	DGKZ	Q13574	1117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	FAM26D	Q5JW98	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	CDC14C	A4D256	554 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	ZBTB39	O15060	712 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	THBS1	P07996	1170 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	ITGA6	P23229	1130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	C16orf46	Q6P387	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PDE8A-215	ENST00000561105	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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