RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556385.5

RIN3-209, Transcript of Ras and Rab interactor 3, humanhuman

TSL 3

Gene RIN3, Length 856 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3-209ENST00000556385 STARD3NLO95772 234 aa22.54■■□□□ 1.2
RIN3-209ENST00000556385 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.54■■□□□ 1.2
RIN3-209ENST00000556385 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.54■■□□□ 1.2
RIN3-209ENST00000556385 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
RIN3-209ENST00000556385 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
RIN3-209ENST00000556385 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.53■■□□□ 1.2
RIN3-209ENST00000556385 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.51■■□□□ 1.19
RIN3-209ENST00000556385 NEUROD2Q15784 382 aa22.51■■□□□ 1.19
RIN3-209ENST00000556385 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
RIN3-209ENST00000556385 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
RIN3-209ENST00000556385 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
RIN3-209ENST00000556385 KCNQ3O43525 872 aa22.49■■□□□ 1.19
RIN3-209ENST00000556385 APAF1O14727 1248 aa22.48■■□□□ 1.19
RIN3-209ENST00000556385 GRIN3BO60391 1043 aa22.48■■□□□ 1.19
RIN3-209ENST00000556385 RFC4P35249 363 aa22.48■■□□□ 1.19
RIN3-209ENST00000556385 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RIN3-209ENST00000556385 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RIN3-209ENST00000556385 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.48■■□□□ 1.19
RIN3-209ENST00000556385 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RIN3-209ENST00000556385 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RIN3-209ENST00000556385 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RIN3-209ENST00000556385 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.45■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.45■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.45■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 A0A087WZG4 1122 aa22.44■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 C4AP0C0L4 1744 aa22.44■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.44■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 UTRNP46939 3433 aa22.42■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 MMP10P09238 476 aa22.42■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 CCDC27Q2M243 656 aa22.42■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 USP16Q9Y5T5 823 aa22.42■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.42■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 COL15A1P39059 1388 aa22.41■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 CHL1O00533 1208 aa22.41■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 ZPR1O75312 459 aa22.41■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 CFAP44Q96MT7 982 aa22.41■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 CCER2I3L3R5 266 aa22.4■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 NGEFQ8N5V2 710 aa22.4■■□□□ 1.18
RIN3-209ENST00000556385 GYS1P13807 737 aa22.39■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 NARFQ9UHQ1 456 aa22.39■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.38■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 A1BGP04217 495 aa22.37■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 GNAI1P63096 354 aa22.37■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 IFT57Q9NWB7 429 aa22.37■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.36■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.36■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 ERBB4Q15303 1308 aa22.35■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 ZNF853P0CG23 659 aa22.35■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.35■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.34■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.34■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 HOXB7P09629 217 aa22.33■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 TGFB2P61812 414 aa22.33■■□□□ 1.17
RIN3-209ENST00000556385 RGL2O15211 777 aa22.32■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 WWC1Q8IX03 1113 aa22.32■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 IL16Q14005 1332 aa22.31■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 FKBP8Q14318 412 aa22.31■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 MBIPQ9NS73 344 aa22.31■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 SCN7AQ01118 1682 aa22.3■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 NBPF26B4DH59 902 aa22.3■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 NBPF15Q8N660 670 aa22.3■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.3■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 TM4SF1P30408 202 aa22.29■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 WDR63Q8IWG1 891 aa22.29■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.29■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.28■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.28■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.28■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.28■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 BCORQ6W2J9 1755 aa22.27■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 A0A0G2JLW4 131 aa22.27■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.27■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.27■■□□□ 1.16
RIN3-209ENST00000556385 CAMTA2O94983 1202 aa22.26■■□□□ 1.15
RIN3-209ENST00000556385 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
RIN3-209ENST00000556385 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RIN3-209ENST00000556385 BCS1LQ9Y276 419 aa22.25■■□□□ 1.15
RIN3-209ENST00000556385 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RIN3-209ENST00000556385 DPEP1P16444 411 aa22.24■■□□□ 1.15
RIN3-209ENST00000556385 DDR1Q08345 913 aa22.24■■□□□ 1.15
RIN3-209ENST00000556385 NFIXQ14938 502 aa22.24■■□□□ 1.15
RIN3-209ENST00000556385 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.23■■□□□ 1.15
RIN3-209ENST00000556385 MYL6BP14649 208 aa22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms