RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 CRKLP46109 303 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 DNAJC10Q8IXB1 793 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 SPON1Q9HCB6 807 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 MIS18AQ9NYP9 233 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 KCNQ3O43525 872 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 TRAPPC3LQ5T215 181 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 MIER1Q8N108 512 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 CFAP44Q96MT7 982 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 MTFR1LQ9H019 292 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 CCDC87Q9NVE4 849 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
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CS-224ENST00000551155 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 CHL1O00533 1208 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 PHF14O94880 888 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
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CS-224ENST00000551155 GNAI1P63096 354 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 WWC1Q8IX03 1113 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 IFT57Q9NWB7 429 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 ZBTB7AO95365 584 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 RFC4P35249 363 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 USP16Q9Y5T5 823 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 COL24A1Q17RW2 1714 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 IL16Q14005 1332 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 ZNF853P0CG23 659 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 CANXP27824 592 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 WDR63Q8IWG1 891 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 C4AP0C0L4 1744 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 A0A087WZG4 1122 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 POLD1P28340 1107 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 AMIGO3Q86WK7 504 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 CHMP4AQ9BY43 222 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-224ENST00000551155 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 ZPR1O75312 459 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 A1BGP04217 495 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 EIF5P55010 431 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 SMIM5Q71RC9 77 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 NLGN1Q8N2Q7 840 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 MBIPQ9NS73 344 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 COL15A1P39059 1388 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 ERBB4Q15303 1308 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa12.13□□□□□ -0.47
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CS-224ENST00000551155 NARFQ9UHQ1 456 aa12.12□□□□□ -0.47
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CS-224ENST00000551155 ARXQ96QS3 562 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 SGIP1Q9BQI5 828 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 KCNA4P22459 653 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 GOLGA2Q08379 1002 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 DUSP27Q5VZP5 1158 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 MSL1Q68DK7 614 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 MYH16Q9H6N6 1097 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 NBPF26B4DH59 902 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 USPL1Q5W0Q7 1092 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 NBPF15Q8N660 670 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-224ENST00000551155 BCORQ6W2J9 1755 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-224ENST00000551155 SCN7AQ01118 1682 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-224ENST00000551155 RGL2O15211 777 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-224ENST00000551155 MYL6BP14649 208 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-224ENST00000551155 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
CS-224ENST00000551155 KRT24Q2M2I5 525 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-224ENST00000551155 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa12.08□□□□□ -0.48
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CS-224ENST00000551155 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP12.08□□□□□ -0.48
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CS-224ENST00000551155 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CS-224ENST00000551155 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa12.08□□□□□ -0.48
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CS-224ENST00000551155 PARP3Q9Y6F1 533 aa12.08□□□□□ -0.48
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CS-224ENST00000551155 CLEC4GQ6UXB4 293 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-224ENST00000551155 C8orf58Q8NAV2 365 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-224ENST00000551155 FANCIQ9NVI1 1328 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-224ENST00000551155 ERVV-1B6SEH8 477 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-224ENST00000551155 E9PSI1 815 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-224ENST00000551155 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-224ENST00000551155 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-224ENST00000551155 CCDC30Q5VVM6 783 aa12.06□□□□□ -0.48
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