RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 SSFA2P28290 1259 aa23.19■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 ADRA2BP18089 450 aa23.18■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 ZNF827Q17R98 1081 aa23.18■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.18■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 MBIPQ9NS73 344 aa23.18■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 CASZ1Q86V15 1759 aa23.17■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 PHF14O94880 888 aa23.16■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 HOXB7P09629 217 aa23.16■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 GOLGA2Q08379 1002 aa23.16■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.16■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 C4AP0C0L4 1744 aa23.16■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 A0A087WZG4 1122 aa23.15■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 RPS6KA4O75676 772 aa23.15■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 ZNF853P0CG23 659 aa23.15■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 E9PSI1 815 aa23.13■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 RFC4P35249 363 aa23.13■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.13■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 ERBB4Q15303 1308 aa23.12■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.11■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 ZPR1O75312 459 aa23.11■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 COL15A1P39059 1388 aa23.11■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.1■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 ARXQ96QS3 562 aa23.1■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.1■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 USP16Q9Y5T5 823 aa23.1■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.09■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.09■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
BRF1-209ENST00000547052 ZNF521Q96K83 1311 aa23.08■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 A1BGP04217 495 aa23.07■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 POLD1P28340 1107 aa23.07■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 MTFR1LQ9H019 292 aa23.07■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.06■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.06■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 STK31Q9BXU1 1019 aa23.06■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 SPON1Q9HCB6 807 aa23.06■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 BCORQ6W2J9 1755 aa23.06■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 SCN7AQ01118 1682 aa23.06■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.05■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.05■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.04■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 NUP98P52948 1817 aa23.03■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 NECTIN2Q92692 538 aa23.03■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 LRP5O75197 1615 aa23.03■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 ZBTB7AO95365 584 aa23.02■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 MYL6BP14649 208 aa23.02■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 KRT24Q2M2I5 525 aa23.02■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.02■■□□□ 1.28
BRF1-209ENST00000547052 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.01■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 HYPKQ9NX55 129 aa23.01■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 NARFQ9UHQ1 456 aa23.01■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 SLFN5Q08AF3 891 aa23■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 C8orf58Q8NAV2 365 aa23■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.98■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.98■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 NBPF26B4DH59 902 aa22.96■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.96■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 MSL1Q68DK7 614 aa22.96■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 NBPF15Q8N660 670 aa22.96■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 ZNF428Q96B54 188 aa22.96■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.96■■□□□ 1.27
BRF1-209ENST00000547052 RGL2O15211 777 aa22.95■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 SMIM5Q71RC9 77 aa22.95■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.95■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 TSPYL6Q8N831 410 aa22.95■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 NPHP1O15259 732 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.93■■□□□ 1.26
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