RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531473.5

TSTA3-214, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSTA3, Length 2,220 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-214ENST00000531473 PTPRCP08575 1304 aa25.14■■□□□ 1.62
TSTA3-214ENST00000531473 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.14■■□□□ 1.62
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TSTA3-214ENST00000531473 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TSTA3-214ENST00000531473 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.13■■□□□ 1.61
TSTA3-214ENST00000531473 HSPA1LP34931 641 aa25.13■■□□□ 1.61
TSTA3-214ENST00000531473 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.12■■□□□ 1.61
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TSTA3-214ENST00000531473 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.12■■□□□ 1.61
TSTA3-214ENST00000531473 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
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TSTA3-214ENST00000531473 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.12■■□□□ 1.61
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TSTA3-214ENST00000531473 LRP6O75581 1613 aa25.11■■□□□ 1.61
TSTA3-214ENST00000531473 USP16Q9Y5T5 823 aa25.11■■□□□ 1.61
TSTA3-214ENST00000531473 JCADQ9P266 1359 aa25.11■■□□□ 1.61
TSTA3-214ENST00000531473 MEIS3Q99687 375 aa25.1■■□□□ 1.61
TSTA3-214ENST00000531473 SLIT2O94813 1529 aa25.1■■□□□ 1.61
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TSTA3-214ENST00000531473 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TSTA3-214ENST00000531473 SEC24BO95487 1268 aa25.08■■□□□ 1.61
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TSTA3-214ENST00000531473 NGLY1Q96IV0 654 aa25.08■■□□□ 1.61
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TSTA3-214ENST00000531473 PDIA6Q15084 440 aa25.08■■□□□ 1.6
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TSTA3-214ENST00000531473 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.06■■□□□ 1.6
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TSTA3-214ENST00000531473 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.05■■□□□ 1.6
TSTA3-214ENST00000531473 MYL6BP14649 208 aa25.05■■□□□ 1.6
TSTA3-214ENST00000531473 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.05■■□□□ 1.6
TSTA3-214ENST00000531473 EXOC5O00471 708 aa25.05■■□□□ 1.6
TSTA3-214ENST00000531473 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.04■■□□□ 1.6
TSTA3-214ENST00000531473 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.04■■□□□ 1.6
TSTA3-214ENST00000531473 PIGBQ92521 554 aa25.04■■□□□ 1.6
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TSTA3-214ENST00000531473 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.04■■□□□ 1.6
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TSTA3-214ENST00000531473 A0A0G2JS52 829 aa24.98■■□□□ 1.59
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TSTA3-214ENST00000531473 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TSTA3-214ENST00000531473 BEND3Q5T5X7 828 aa24.94■■□□□ 1.58
TSTA3-214ENST00000531473 CEP85Q6P2H3 762 aa24.94■■□□□ 1.58
TSTA3-214ENST00000531473 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.94■■□□□ 1.58
TSTA3-214ENST00000531473 COPS6Q7L5N1 327 aa24.94■■□□□ 1.58
TSTA3-214ENST00000531473 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.93■■□□□ 1.58
TSTA3-214ENST00000531473 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TSTA3-214ENST00000531473 HYPKQ9NX55 129 aa24.93■■□□□ 1.58
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