RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527677.1

TSTA3-207, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-207ENST00000527677 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.54■■□□□ 1.04
TSTA3-207ENST00000527677 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-207ENST00000527677 NBPF14Q5TI25 921 aa21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-207ENST00000527677 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-207ENST00000527677 SOCS7O14512 581 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-207ENST00000527677 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-207ENST00000527677 USP16Q9Y5T5 823 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-207ENST00000527677 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 VAMP4O75379 141 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 KRT24Q2M2I5 525 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 AK7Q96M32 723 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 STK31Q9BXU1 1019 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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TSTA3-207ENST00000527677 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 ADRA2BP18089 450 aa21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 TSPYL6Q8N831 410 aa21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 STK32BQ9NY57 414 aa21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 RPS6KA4O75676 772 aa21.48■■□□□ 1.03
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TSTA3-207ENST00000527677 AKT1S1Q96B36 256 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 HYPKQ9NX55 129 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 A0A087WZG4 1122 aa21.47■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 KCNQ4P56696 695 aa21.47■■□□□ 1.03
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TSTA3-207ENST00000527677 GNPATO15228 680 aa21.46■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 SSFA2P28290 1259 aa21.46■■□□□ 1.03
TSTA3-207ENST00000527677 A1BGP04217 495 aa21.45■■□□□ 1.02
TSTA3-207ENST00000527677 SLC15A2Q16348 729 aa21.45■■□□□ 1.02
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TSTA3-207ENST00000527677 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.45■■□□□ 1.02
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TSTA3-207ENST00000527677 NBPF26B4DH59 902 aa21.42■■□□□ 1.02
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TSTA3-207ENST00000527677 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-207ENST00000527677 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-207ENST00000527677 NBPF15Q8N660 670 aa21.42■■□□□ 1.02
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TSTA3-207ENST00000527677 SLC4A2P04920 1241 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-207ENST00000527677 ZNF827Q17R98 1081 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-207ENST00000527677 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-207ENST00000527677 COL15A1P39059 1388 aa21.4■■□□□ 1.02
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TSTA3-207ENST00000527677 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-207ENST00000527677 RFC4P35249 363 aa21.38■■□□□ 1.01
TSTA3-207ENST00000527677 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.38■■□□□ 1.01
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TSTA3-207ENST00000527677 PTPRCP08575 1304 aa21.37■■□□□ 1.01
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TSTA3-207ENST00000527677 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.36■■□□□ 1.01
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TSTA3-207ENST00000527677 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.34■■□□□ 1.01
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TSTA3-207ENST00000527677 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
TSTA3-207ENST00000527677 ANXA1P04083 346 aa21.32■■□□□ 1
TSTA3-207ENST00000527677 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.32■■□□□ 1
TSTA3-207ENST00000527677 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
TSTA3-207ENST00000527677 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
TSTA3-207ENST00000527677 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
TSTA3-207ENST00000527677 KSR2Q6VAB6 950 aa21.31■■□□□ 1
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