RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525939.1

ABCA7-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 7, human

TSL 3

Gene ABCA7, Length 374 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA7-208	ENST00000525939	MSL1	Q68DK7	614 aa		29.25	■■■□□ 2.27
ABCA7-208	ENST00000525939	RFC4	P35249	363 aa		29.24	■■■□□ 2.27
ABCA7-208	ENST00000525939	SYT17	Q9BSW7	474 aa		29.24	■■■□□ 2.27
ABCA7-208	ENST00000525939	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
ABCA7-208	ENST00000525939	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		29.23	■■■□□ 2.27
ABCA7-208	ENST00000525939	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		29.23	■■■□□ 2.27
ABCA7-208	ENST00000525939	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		29.22	■■■□□ 2.27
ABCA7-208	ENST00000525939	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		29.22	■■■□□ 2.27
ABCA7-208	ENST00000525939	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
ABCA7-208	ENST00000525939	GYS1	P13807	737 aa		29.21	■■■□□ 2.27
ABCA7-208	ENST00000525939	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.27
ABCA7-208	ENST00000525939	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		29.2	■■■□□ 2.26
ABCA7-208	ENST00000525939	COL15A1	P39059	1388 aa		29.2	■■■□□ 2.26
ABCA7-208	ENST00000525939	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
ABCA7-208	ENST00000525939	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
ABCA7-208	ENST00000525939	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		29.18	■■■□□ 2.26
ABCA7-208	ENST00000525939	MRS2	Q9HD23	443 aa		29.17	■■■□□ 2.26
ABCA7-208	ENST00000525939	USP16	Q9Y5T5	823 aa		29.17	■■■□□ 2.26
ABCA7-208	ENST00000525939	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		29.16	■■■□□ 2.26
ABCA7-208	ENST00000525939	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
ABCA7-208	ENST00000525939	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
ABCA7-208	ENST00000525939	NEUROD2	Q15784	382 aa		29.16	■■■□□ 2.26
ABCA7-208	ENST00000525939	NARF	Q9UHQ1	456 aa		29.15	■■■□□ 2.26
ABCA7-208	ENST00000525939	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
ABCA7-208	ENST00000525939	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		29.14	■■■□□ 2.26
ABCA7-208	ENST00000525939		A0A087WZG4	1122 aa		29.13	■■■□□ 2.25
ABCA7-208	ENST00000525939	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		29.13	■■■□□ 2.25
ABCA7-208	ENST00000525939	APAF1	O14727	1248 aa		29.13	■■■□□ 2.25
ABCA7-208	ENST00000525939	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
ABCA7-208	ENST00000525939	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
ABCA7-208	ENST00000525939	ZPR1	O75312	459 aa		29.12	■■■□□ 2.25
ABCA7-208	ENST00000525939	A1BG	P04217	495 aa		29.12	■■■□□ 2.25
ABCA7-208	ENST00000525939	MMP10	P09238	476 aa		29.12	■■■□□ 2.25
ABCA7-208	ENST00000525939	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		29.12	■■■□□ 2.25
ABCA7-208	ENST00000525939	SCN7A	Q01118	1682 aa		29.12	■■■□□ 2.25
ABCA7-208	ENST00000525939	CHL1	O00533	1208 aa		29.1	■■■□□ 2.25
ABCA7-208	ENST00000525939	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		29.1	■■■□□ 2.25
ABCA7-208	ENST00000525939	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		29.09	■■■□□ 2.25
ABCA7-208	ENST00000525939	FKBP8	Q14318	412 aa		29.09	■■■□□ 2.25
ABCA7-208	ENST00000525939	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
ABCA7-208	ENST00000525939	TM4SF1	P30408	202 aa		29.07	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		29.06	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		29.06	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	KLHL34	Q8N239	644 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	CFAP44	Q96MT7	982 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	UTRN	P46939	3433 aa		29.04	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		29.04	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	NBPF26	B4DH59	902 aa		29.04	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	NBPF15	Q8N660	670 aa		29.04	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		29.03	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	CCDC27	Q2M243	656 aa		29.03	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		29.03	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	ERBB4	Q15303	1308 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	RGL2	O15211	777 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	ZNF853	P0CG23	659 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	DDR1	Q08345	913 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ABCA7-208	ENST00000525939	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
ABCA7-208	ENST00000525939	CAMTA2	O94983	1202 aa		29	■■■□□ 2.23
ABCA7-208	ENST00000525939	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		29	■■■□□ 2.23
ABCA7-208	ENST00000525939	NFIX	Q14938	502 aa		28.99	■■■□□ 2.23
ABCA7-208	ENST00000525939	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
ABCA7-208	ENST00000525939	IFT57	Q9NWB7	429 aa		28.99	■■■□□ 2.23
ABCA7-208	ENST00000525939	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
ABCA7-208	ENST00000525939	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
ABCA7-208	ENST00000525939	GNAI1	P63096	354 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ABCA7-208	ENST00000525939	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ABCA7-208	ENST00000525939	HOXB7	P09629	217 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ABCA7-208	ENST00000525939	TGFB2	P61812	414 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ABCA7-208	ENST00000525939	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
ABCA7-208	ENST00000525939	CHD4	Q14839	1912 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ABCA7-208	ENST00000525939	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.23
ABCA7-208	ENST00000525939	MBIP	Q9NS73	344 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	NUP98	P52948	1817 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	WWC1	Q8IX03	1113 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	PDIA6	Q15084	440 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	NGEF	Q8N5V2	710 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	SERPINB2	P05120	415 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	GPR162	Q16538	588 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	IL16	Q14005	1332 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	KRT24	Q2M2I5	525 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ABCA7-208	ENST00000525939	CCER2	I3L3R5	266 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	SETDB2	Q96T68	719 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	MYL6B	P14649	208 aa		28.86	■■■□□ 2.21

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