RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CLVS1-209ENST00000522928 BACH1O14867 736 aa7.66□□□□□ -1.18
CLVS1-209ENST00000522928 VSIG8P0DPA2 414 aa7.66□□□□□ -1.18
CLVS1-209ENST00000522928 ITGA6P23229 1130 aa7.66□□□□□ -1.18
CLVS1-209ENST00000522928 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CLVS1-209ENST00000522928 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.66□□□□□ -1.18
CLVS1-209ENST00000522928 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CLVS1-209ENST00000522928 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.66□□□□□ -1.18
CLVS1-209ENST00000522928 ATP4AP20648 1035 aa7.65□□□□□ -1.18
CLVS1-209ENST00000522928 DBN1Q16643 649 aa7.65□□□□□ -1.18
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CLVS1-209ENST00000522928 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CLVS1-209ENST00000522928 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.65□□□□□ -1.18
CLVS1-209ENST00000522928 HCN2Q9UL51 889 aa7.65□□□□□ -1.18
CLVS1-209ENST00000522928 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.65□□□□□ -1.18
CLVS1-209ENST00000522928 EML1O00423 815 aa7.64□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 MSX1P28360 303 aa7.64□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 WEE1P30291 646 aa7.64□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.64□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 TXLNAP40222 546 aa7.63□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 TEAD4Q15561 434 aa7.63□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 GNASQ5JWF2 1037 aa7.63□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 F11P03951 625 aa7.62□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 PLA2G4AP47712 749 aa7.62□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 KRT76Q01546 638 aa7.62□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 OCLNQ16625 522 aa7.62□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.62□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.62□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.61□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 NOS2P35228 1153 aa7.61□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.61□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.61□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.61□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.6□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 A0A1B0GTH6 734 aa7.6□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 CARNS1A5YM72 827 aa7.6□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 GMPRP36959 345 aa7.6□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.6□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 ARID3AQ99856 593 aa7.6□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.6□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 GPAMQ9HCL2 828 aa7.6□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 CABP1Q9NZU7 370 aa7.6□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 GAS6Q14393 721 aa7.59□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.59□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.59□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 RUBCNLQ9H714 662 aa7.59□□□□□ -1.19
CLVS1-209ENST00000522928 IGFBP4P22692 258 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 ZIC5Q96T25 663 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 HINFPQ9BQA5 517 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 NISCHQ9Y2I1 1504 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 SERTM1A2A2V5 107 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 IRF7Q92985 503 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 AIDAQ96BJ3 306 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 PRMT3O60678 531 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 A0A1W2PNR3 127 aa7.54□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 CDC14CA4D256 554 aa7.54□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 GPR25O00155 361 aa7.54□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 SCNN1AP37088 669 aa7.54□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 GSK3AP49840 483 aa7.54□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 XP32Q5T750 250 aa7.54□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.54□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 SV2AQ7L0J3 742 aa7.54□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 GMCL1Q96IK5 515 aa7.54□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.54□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.54□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 BCS1LQ9Y276 419 aa7.54□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 BNIP3LO60238 219 aa7.53□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.53□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.53□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms