RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	ADCY5	O95622	1261 aa		9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	CLCN1	P35523	988 aa		9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	EVI5L	Q96CN4	794 aa		9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC69	A6NI79	296 aa		9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	ATP8B2	P98198	1209 aa		9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	HYPK	Q9NX55	129 aa		9.47	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	SNRK	Q9NRH2	765 aa		9.46	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	ADGRL2	O95490	1459 aa		9.46	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	PIK3R4	Q99570	1358 aa		9.46	□□□□□ -0.89
NEK1-208	ENST00000512193	METTL24	Q5JXM2	366 aa		9.46	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		9.46	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		9.46	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		9.46	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		9.46	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	TDO2	P48775	406 aa		9.46	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	G2E3	Q7L622	706 aa		9.46	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2H	P62256	183 aa		9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	ASXL2	Q76L83	1435 aa		9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	GOLIM4	O00461	696 aa		9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	CFAP100	Q494V2	611 aa		9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	USP48	Q86UV5	1035 aa		9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	USP26	Q9BXU7	913 aa		9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	C8orf76	Q96K31	380 aa		9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	ABCF2	Q9UG63	623 aa		9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF165	P49910	485 aa		9.45	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	CDKL5	O76039	1030 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	CCP110	O43303	1012 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	OFD1	O75665	1012 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	HAND2	P61296	217 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	AIDA	Q96BJ3	306 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	ANO10	Q9NW15	660 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	BIN1	O00499	593 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	SLC39A6	Q13433	755 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	FSIP1	Q8NA03	581 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	CAGE1	Q8TC20	777 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	KDM6B	O15054	1643 aa		9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	TXLNA	P40222	546 aa		9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	ANAPC15	P60006	121 aa		9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	PTPN14	Q15678	1187 aa		9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	EYA1	Q99502	592 aa		9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	CBX1	P83916	185 aa		9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	BRF1	Q92994	677 aa		9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	NEK1	Q96PY6	1258 aa		9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	SMARCE1	Q969G3	411 aa		9.43	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	RAI14	Q9P0K7	980 aa		9.42	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	DTNB	O60941	627 aa		9.42	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	TNNT1	P13805	278 aa		9.42	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	CHML	P26374	656 aa		9.42	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	SMTNL1	A8MU46	457 aa		9.42	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	CPA1	P15085	419 aa		9.42	□□□□□ -0.9
NEK1-208	ENST00000512193	COPS6	Q7L5N1	327 aa		9.42	□□□□□ -0.9

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