RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 ATG3Q9NT62 314 aa26.01■■□□□ 1.75
SMIM20-201ENST00000506197 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.99■■□□□ 1.75
SMIM20-201ENST00000506197 KCNQ3O43525 872 aa25.99■■□□□ 1.75
SMIM20-201ENST00000506197 SIK1P57059 783 aa25.99■■□□□ 1.75
SMIM20-201ENST00000506197 AK7Q96M32 723 aa25.99■■□□□ 1.75
SMIM20-201ENST00000506197 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.98■■□□□ 1.75
SMIM20-201ENST00000506197 YY1P25490 414 aa25.98■■□□□ 1.75
SMIM20-201ENST00000506197 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.98■■□□□ 1.75
SMIM20-201ENST00000506197 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.97■■□□□ 1.75
SMIM20-201ENST00000506197 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SMIM20-201ENST00000506197 KLHL34Q8N239 644 aa25.97■■□□□ 1.75
SMIM20-201ENST00000506197 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.97■■□□□ 1.75
SMIM20-201ENST00000506197 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SMIM20-201ENST00000506197 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SMIM20-201ENST00000506197 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.94■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 MSL1Q68DK7 614 aa25.94■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.94■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.94■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 CHD4Q14839 1912 aa25.94■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.93■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 ATP6V1AP38606 617 aa25.92■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 ITPK1Q13572 414 aa25.92■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 PHF14O94880 888 aa25.91■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.91■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 TJP1Q07157 1748 aa25.91■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 KRT24Q2M2I5 525 aa25.9■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.9■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.9■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 SSFA2P28290 1259 aa25.89■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
SMIM20-201ENST00000506197 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SMIM20-201ENST00000506197 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SMIM20-201ENST00000506197 GNPATO15228 680 aa25.87■■□□□ 1.73
SMIM20-201ENST00000506197 HOXB7P09629 217 aa25.87■■□□□ 1.73
SMIM20-201ENST00000506197 SMIM5Q71RC9 77 aa25.87■■□□□ 1.73
SMIM20-201ENST00000506197 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
SMIM20-201ENST00000506197 TSPYL6Q8N831 410 aa25.86■■□□□ 1.73
SMIM20-201ENST00000506197 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SMIM20-201ENST00000506197 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.85■■□□□ 1.73
SMIM20-201ENST00000506197 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.85■■□□□ 1.73
SMIM20-201ENST00000506197 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.84■■□□□ 1.73
SMIM20-201ENST00000506197 CACNA1FO60840 1977 aa25.84■■□□□ 1.73
SMIM20-201ENST00000506197 GPR162Q16538 588 aa25.83■■□□□ 1.73
SMIM20-201ENST00000506197 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.83■■□□□ 1.73
SMIM20-201ENST00000506197 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.82■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 STARD3NLO95772 234 aa25.82■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.82■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 VAMP4O75379 141 aa25.81■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 USP16Q9Y5T5 823 aa25.8■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.79■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 NECTIN2Q92692 538 aa25.79■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF428Q96B54 188 aa25.79■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.79■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 C4AP0C0L4 1744 aa25.78■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 STK31Q9BXU1 1019 aa25.77■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.77■■□□□ 1.72
SMIM20-201ENST00000506197 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 ERBB4Q15303 1308 aa25.75■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 ADRA2BP18089 450 aa25.74■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.74■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.73■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.73■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.72■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.72■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 RPS6KA4O75676 772 aa25.71■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 A1BGP04217 495 aa25.71■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.71■■□□□ 1.71
SMIM20-201ENST00000506197 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.72e-7■□□□□ 10.5
SMIM20-201ENST00000506197 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.7■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.7■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 MMP10P09238 476 aa25.69■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 MYL6BP14649 208 aa25.69■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.69■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.69■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 SLC4A2P04920 1241 aa25.68■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 RFC4P35249 363 aa25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 480.2 ms