RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
SH3BP2-210ENST00000505941 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
SH3BP2-210ENST00000505941 UBR2Q8IWV8 1755 aa27.73■■■□□ 2.03
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNQ3O43525 872 aa27.72■■■□□ 2.03
SH3BP2-210ENST00000505941 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
SH3BP2-210ENST00000505941 NEUROD2Q15784 382 aa27.71■■■□□ 2.03
SH3BP2-210ENST00000505941 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.71■■■□□ 2.03
SH3BP2-210ENST00000505941 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.71■■■□□ 2.03
SH3BP2-210ENST00000505941 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A087WZG4 1122 aa27.7■■■□□ 2.02
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SH3BP2-210ENST00000505941 GYS1P13807 737 aa27.7■■■□□ 2.02
SH3BP2-210ENST00000505941 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.7■■■□□ 2.02
SH3BP2-210ENST00000505941 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.7■■■□□ 2.02
SH3BP2-210ENST00000505941 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.69■■■□□ 2.02
SH3BP2-210ENST00000505941 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
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SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
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SH3BP2-210ENST00000505941 NARFQ9UHQ1 456 aa27.66■■■□□ 2.02
SH3BP2-210ENST00000505941 COL15A1P39059 1388 aa27.65■■■□□ 2.02
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SH3BP2-210ENST00000505941 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.64■■■□□ 2.02
SH3BP2-210ENST00000505941 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
SH3BP2-210ENST00000505941 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.64■■■□□ 2.02
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SH3BP2-210ENST00000505941 MRS2Q9HD23 443 aa27.61■■■□□ 2.01
SH3BP2-210ENST00000505941 C4AP0C0L4 1744 aa27.6■■■□□ 2.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.58■■■□□ 2.01
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SH3BP2-210ENST00000505941 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
SH3BP2-210ENST00000505941 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.56■■■□□ 2
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SH3BP2-210ENST00000505941 TGFB2P61812 414 aa27.54■■■□□ 2
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SH3BP2-210ENST00000505941 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
SH3BP2-210ENST00000505941 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.52■■■□□ 2
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SH3BP2-210ENST00000505941 NFIXQ14938 502 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.51■■□□□ 1.99
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SH3BP2-210ENST00000505941 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.49■■□□□ 1.99
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SH3BP2-210ENST00000505941 SETDB2Q96T68 719 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-210ENST00000505941 NBPF26B4DH59 902 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-210ENST00000505941 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
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SH3BP2-210ENST00000505941 NGEFQ8N5V2 710 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-210ENST00000505941 NBPF15Q8N660 670 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-210ENST00000505941 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A0G2JLW4 131 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 CAMTA2O94983 1202 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 ERBB4Q15303 1308 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 MYL6BP14649 208 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 GNAI1P63096 354 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.43■■□□□ 1.98
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SH3BP2-210ENST00000505941 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 RGL2O15211 777 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 DPEP1P16444 411 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 IFT57Q9NWB7 429 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 PIM2Q9P1W9 311 aa27.4■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 BCS1LQ9Y276 419 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2-210ENST00000505941 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC27Q2M243 656 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 MBIPQ9NS73 344 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 SCN7AQ01118 1682 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 HOXB7P09629 217 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 ST5P78524 1137 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 CNBD1Q8NA66 436 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 NECTIN2Q92692 538 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.36■■□□□ 1.97
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