RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 RUNDC1Q96C34 613 aa22.27■■□□□ 1.16
KCNQ1-205ENST00000496887 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
KCNQ1-205ENST00000496887 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
KCNQ1-205ENST00000496887 ANP32CO43423 234 aa22.26■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 GYS1P13807 737 aa22.25■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC184Q52MB2 194 aa22.25■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 NEUROD2Q15784 382 aa22.24■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.24■■□□□ 1.15
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KCNQ1-205ENST00000496887 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 COL15A1P39059 1388 aa22.23■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.22■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.22■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 MMP10P09238 476 aa22.22■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.22■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.22■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 USP16Q9Y5T5 823 aa22.22■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 A1BGP04217 495 aa22.21■■□□□ 1.15
KCNQ1-205ENST00000496887 ZPR1O75312 459 aa22.2■■□□□ 1.14
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KCNQ1-205ENST00000496887 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.19■■□□□ 1.14
KCNQ1-205ENST00000496887 NARFQ9UHQ1 456 aa22.19■■□□□ 1.14
KCNQ1-205ENST00000496887 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.19■■□□□ 1.14
KCNQ1-205ENST00000496887 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.19■■□□□ 1.14
KCNQ1-205ENST00000496887 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.18■■□□□ 1.14
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KCNQ1-205ENST00000496887 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.17■■□□□ 1.14
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
KCNQ1-205ENST00000496887 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNQ1-205ENST00000496887 A0A087WZG4 1122 aa22.16■■□□□ 1.14
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KCNQ1-205ENST00000496887 MRS2Q9HD23 443 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNQ1-205ENST00000496887 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.16■■□□□ 1.14
KCNQ1-205ENST00000496887 APAF1O14727 1248 aa22.15■■□□□ 1.14
KCNQ1-205ENST00000496887 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
KCNQ1-205ENST00000496887 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
KCNQ1-205ENST00000496887 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.14■■□□□ 1.13
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KCNQ1-205ENST00000496887 TM4SF1P30408 202 aa22.13■■□□□ 1.13
KCNQ1-205ENST00000496887 DDR1Q08345 913 aa22.13■■□□□ 1.13
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KCNQ1-205ENST00000496887 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.13■■□□□ 1.13
KCNQ1-205ENST00000496887 GPR162Q16538 588 aa22.12■■□□□ 1.13
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KCNQ1-205ENST00000496887 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-205ENST00000496887 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.1■■□□□ 1.13
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KCNQ1-205ENST00000496887 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.07■■□□□ 1.12
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KCNQ1-205ENST00000496887 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.05■■□□□ 1.12
KCNQ1-205ENST00000496887 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.05■■□□□ 1.12
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KCNQ1-205ENST00000496887 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
KCNQ1-205ENST00000496887 KRT24Q2M2I5 525 aa22.03■■□□□ 1.12
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KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF853P0CG23 659 aa22.01■■□□□ 1.11
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KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22■■□□□ 1.11
KCNQ1-205ENST00000496887 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.99■■□□□ 1.11
KCNQ1-205ENST00000496887 NUP98P52948 1817 aa21.99■■□□□ 1.11
KCNQ1-205ENST00000496887 GRIN3BO60391 1043 aa21.99■■□□□ 1.11
KCNQ1-205ENST00000496887 GNAI1P63096 354 aa21.99■■□□□ 1.11
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.99■■□□□ 1.11
KCNQ1-205ENST00000496887 NECTIN2Q92692 538 aa21.99■■□□□ 1.11
KCNQ1-205ENST00000496887 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.98■■□□□ 1.11
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