RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496153.5

BUD23-218, Transcript of BUD23, rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor, humanhuman

TSL 4

Gene BUD23, Length 505 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23-218ENST00000496153 KCNQ3O43525 872 aa24.52■■□□□ 1.52
BUD23-218ENST00000496153 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
BUD23-218ENST00000496153 MSL1Q68DK7 614 aa24.52■■□□□ 1.52
BUD23-218ENST00000496153 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
BUD23-218ENST00000496153 SMIM5Q71RC9 77 aa24.51■■□□□ 1.51
BUD23-218ENST00000496153 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
BUD23-218ENST00000496153 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
BUD23-218ENST00000496153 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.5■■□□□ 1.51
BUD23-218ENST00000496153 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.5■■□□□ 1.51
BUD23-218ENST00000496153 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.5■■□□□ 1.51
BUD23-218ENST00000496153 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
BUD23-218ENST00000496153 APAF1O14727 1248 aa24.49■■□□□ 1.51
BUD23-218ENST00000496153 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.49■■□□□ 1.51
BUD23-218ENST00000496153 COL15A1P39059 1388 aa24.49■■□□□ 1.51
BUD23-218ENST00000496153 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
BUD23-218ENST00000496153 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
BUD23-218ENST00000496153 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.47■■□□□ 1.51
BUD23-218ENST00000496153 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.47■■□□□ 1.51
BUD23-218ENST00000496153 ZPR1O75312 459 aa24.46■■□□□ 1.51
BUD23-218ENST00000496153 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 A0A087WZG4 1122 aa24.45■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 KLHL34Q8N239 644 aa24.45■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 USP16Q9Y5T5 823 aa24.43■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.42■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 GYS1P13807 737 aa24.42■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 SYT17Q9BSW7 474 aa24.42■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 SCN7AQ01118 1682 aa24.41■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 A1BGP04217 495 aa24.41■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 NARFQ9UHQ1 456 aa24.41■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.4■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 MMP10P09238 476 aa24.4■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
BUD23-218ENST00000496153 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.39■■□□□ 1.49
BUD23-218ENST00000496153 CHL1O00533 1208 aa24.38■■□□□ 1.49
BUD23-218ENST00000496153 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.38■■□□□ 1.49
BUD23-218ENST00000496153 CFAP44Q96MT7 982 aa24.38■■□□□ 1.49
BUD23-218ENST00000496153 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.38■■□□□ 1.49
BUD23-218ENST00000496153 BCORQ6W2J9 1755 aa24.38■■□□□ 1.49
BUD23-218ENST00000496153 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
BUD23-218ENST00000496153 GNAI1P63096 354 aa24.36■■□□□ 1.49
BUD23-218ENST00000496153 CCDC27Q2M243 656 aa24.36■■□□□ 1.49
BUD23-218ENST00000496153 IFT57Q9NWB7 429 aa24.36■■□□□ 1.49
BUD23-218ENST00000496153 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.36■■□□□ 1.49
BUD23-218ENST00000496153 FKBP8Q14318 412 aa24.35■■□□□ 1.49
BUD23-218ENST00000496153 ERBB4Q15303 1308 aa24.35■■□□□ 1.49
BUD23-218ENST00000496153 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.34■■□□□ 1.49
BUD23-218ENST00000496153 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
BUD23-218ENST00000496153 CCER2I3L3R5 266 aa24.32■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.32■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 NGEFQ8N5V2 710 aa24.31■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 MBIPQ9NS73 344 aa24.31■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.31■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 NBPF26B4DH59 902 aa24.3■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 HOXB7P09629 217 aa24.3■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 WWC1Q8IX03 1113 aa24.3■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 NBPF15Q8N660 670 aa24.3■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 ZNF853P0CG23 659 aa24.29■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.28■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.28■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 RGL2O15211 777 aa24.27■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 CAMTA2O94983 1202 aa24.27■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 TM4SF1P30408 202 aa24.27■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 NFIXQ14938 502 aa24.27■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.27■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.27■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.27■■□□□ 1.48
BUD23-218ENST00000496153 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.26■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 MYL6BP14649 208 aa24.26■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 DDR1Q08345 913 aa24.26■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.26■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 IL16Q14005 1332 aa24.26■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.25■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.25■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 NUP98P52948 1817 aa24.24■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.24■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.24■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 SETDB2Q96T68 719 aa24.24■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 TGFB2P61812 414 aa24.23■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 GPR162Q16538 588 aa24.23■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 KRT24Q2M2I5 525 aa24.23■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.23■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.23■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 WDR63Q8IWG1 891 aa24.23■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
BUD23-218ENST00000496153 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.21■■□□□ 1.47
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