RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-216	ENST00000495123	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	GNPAT	O15228	680 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	PHF14	O94880	888 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	ZBTB7A	O95365	584 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	MIER1	Q8N108	512 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	CCER2	I3L3R5	266 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	SSFA2	P28290	1259 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PKP4-216	ENST00000495123	RPS6KA4	O75676	772 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	USP16	Q9Y5T5	823 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	LRP5	O75197	1615 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	PTGER2	P43116	358 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	MTFR1L	Q9H019	292 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	SPON1	Q9HCB6	807 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	CHL1	O00533	1208 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	STARD3NL	O95772	234 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	A1BG	P04217	495 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	CCDC27	Q2M243	656 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	MSL1	Q68DK7	614 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	WWC1	Q8IX03	1113 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	ZNF853	P0CG23	659 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	KRT24	Q2M2I5	525 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	CFAP44	Q96MT7	982 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	MBIP	Q9NS73	344 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	C4A	P0C0L4	1744 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	IFT57	Q9NWB7	429 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	COL15A1	P39059	1388 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	RFC4	P35249	363 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKP4-216	ENST00000495123	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	GNAI1	P63096	354 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	GYS1	P13807	737 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	POLD1	P28340	1107 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	WDR63	Q8IWG1	891 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	ARX	Q96QS3	562 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	NARF	Q9UHQ1	456 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	IL16	Q14005	1332 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	ZNF521	Q96K83	1311 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	ZPR1	O75312	459 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123		A0A087WZG4	1122 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	CAMTA2	O94983	1202 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	ANXA1	P04083	346 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	MMP10	P09238	476 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	MYL6B	P14649	208 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	PDIA6	Q15084	440 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	PROSER3	Q2NL68	480 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKP4-216	ENST00000495123	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61

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