RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491824.1

HCLS1-210, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 3

Gene HCLS1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-210ENST00000491824 ZPR1O75312 459 aa21.63■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.63■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 A0A087WZG4 1122 aa21.62■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.62■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.62■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 SMIM5Q71RC9 77 aa21.61■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.61■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 CCDC184Q52MB2 194 aa21.6■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.6■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 COL15A1P39059 1388 aa21.6■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 KCNQ3O43525 872 aa21.59■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.59■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.58■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 SYT17Q9BSW7 474 aa21.57■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 APAF1O14727 1248 aa21.56■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 MMP10P09238 476 aa21.56■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 GYS1P13807 737 aa21.56■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.56■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 C4AP0C0L4 1744 aa21.55■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.54■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 NARFQ9UHQ1 456 aa21.54■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.53■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.53■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 A1BGP04217 495 aa21.52■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.52■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 USP16Q9Y5T5 823 aa21.52■■□□□ 1.04
HCLS1-210ENST00000491824 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.5■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.49■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.48■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 GNAI1P63096 354 aa21.48■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 FKBP8Q14318 412 aa21.48■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.48■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 CFAP44Q96MT7 982 aa21.48■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 CHL1O00533 1208 aa21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 NGEFQ8N5V2 710 aa21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 IFT57Q9NWB7 429 aa21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 ERBB4Q15303 1308 aa21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 GPR162Q16538 588 aa21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-210ENST00000491824 NPHP1O15259 732 aa21.45■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 CCDC27Q2M243 656 aa21.45■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.45■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.45■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.43■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 SCN7AQ01118 1682 aa21.43■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 HOXB7P09629 217 aa21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 MYL6BP14649 208 aa21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 RGL2O15211 777 aa21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 TGFB2P61812 414 aa21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 NFIXQ14938 502 aa21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 SETDB2Q96T68 719 aa21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 MBIPQ9NS73 344 aa21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 NBPF26B4DH59 902 aa21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 CAMTA2O94983 1202 aa21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 TM4SF1P30408 202 aa21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 DDR1Q08345 913 aa21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 NBPF15Q8N660 670 aa21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-210ENST00000491824 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.39■■□□□ 1.01
HCLS1-210ENST00000491824 WWC1Q8IX03 1113 aa21.39■■□□□ 1.01
HCLS1-210ENST00000491824 IL16Q14005 1332 aa21.38■■□□□ 1.01
HCLS1-210ENST00000491824 GRIN3BO60391 1043 aa21.38■■□□□ 1.01
HCLS1-210ENST00000491824 SERPINB2P05120 415 aa21.38■■□□□ 1.01
HCLS1-210ENST00000491824 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.38■■□□□ 1.01
HCLS1-210ENST00000491824 ZNF853P0CG23 659 aa21.37■■□□□ 1.01
HCLS1-210ENST00000491824 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.37■■□□□ 1.01
HCLS1-210ENST00000491824 BCORQ6W2J9 1755 aa21.36■■□□□ 1.01
HCLS1-210ENST00000491824 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.36■■□□□ 1.01
HCLS1-210ENST00000491824 ST5P78524 1137 aa21.36■■□□□ 1.01
HCLS1-210ENST00000491824 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.36■■□□□ 1.01
HCLS1-210ENST00000491824 NECTIN2Q92692 538 aa21.36■■□□□ 1.01
HCLS1-210ENST00000491824 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HCLS1-210ENST00000491824 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.35■■□□□ 1.01
HCLS1-210ENST00000491824 CNBD1Q8NA66 436 aa21.35■■□□□ 1.01
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