RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 APAF1O14727 1248 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRVP-202ENST00000490575 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRVP-202ENST00000490575 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRVP-202ENST00000490575 ARXQ96QS3 562 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRVP-202ENST00000490575 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRVP-202ENST00000490575 MRS2Q9HD23 443 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRVP-202ENST00000490575 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRVP-202ENST00000490575 A1BGP04217 495 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRVP-202ENST00000490575 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRVP-202ENST00000490575 GYS1P13807 737 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 SYT17Q9BSW7 474 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 ADRA2BP18089 450 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 RFC4P35249 363 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 COL15A1P39059 1388 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 POLD1P28340 1107 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 FKBP8Q14318 412 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 NBPF26B4DH59 902 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 STARD3NLO95772 234 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 KRT24Q2M2I5 525 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 NBPF15Q8N660 670 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRVP-202ENST00000490575 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 MMP10P09238 476 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 KLHL34Q8N239 644 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 UTRNP46939 3433 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 CHL1O00533 1208 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 DDR1Q08345 913 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 NARFQ9UHQ1 456 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 SCN7AQ01118 1682 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 BCORQ6W2J9 1755 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF853P0CG23 659 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 TM4SF1P30408 202 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRVP-202ENST00000490575 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.32■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 ZPR1O75312 459 aa21.31■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 CAMTA2O94983 1202 aa21.31■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 NFIXQ14938 502 aa21.31■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 MBIPQ9NS73 344 aa21.31■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 PDIA6Q15084 440 aa21.3■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.3■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 CFAP44Q96MT7 982 aa21.3■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.29■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 ANXA1P04083 346 aa21.29■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 PROSER3Q2NL68 480 aa21.29■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.29■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 WWC1Q8IX03 1113 aa21.29■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 NECTIN2Q92692 538 aa21.29■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.28■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.28■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 MYL6BP14649 208 aa21.27■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.27■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.27■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 NGEFQ8N5V2 710 aa21.27■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.27■■□□□ 1
PTPRVP-202ENST00000490575 A0A087WZG4 1122 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC27Q2M243 656 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 IFT57Q9NWB7 429 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.25■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 HLFQ16534 295 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 NUP98P52948 1817 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 MIER1Q8N108 512 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 SERPINB2P05120 415 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 GNAI1P63096 354 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRVP-202ENST00000490575 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms