RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489697.1

RAI1-204, Transcript of retinoic acid induced 1, humanhuman

TSL 3

Gene RAI1, Length 1,570 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI1-204ENST00000489697 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 NECTIN2Q92692 538 aa20.56■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.56■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 A1BGP04217 495 aa20.55■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.55■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 C4BP0C0L5 1744 aa20.55■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 VAMP4O75379 141 aa20.55■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 ZNF827Q17R98 1081 aa20.55■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.55■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 AK7Q96M32 723 aa20.55■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.55■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 AKT1S1Q96B36 256 aa20.54■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.54■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 GNPATO15228 680 aa20.53■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 NBPF14Q5TI25 921 aa20.53■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 STK32BQ9NY57 414 aa20.53■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.53■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 SLC15A2Q16348 729 aa20.52■□□□□ 0.88
RAI1-204ENST00000489697 NBPF26B4DH59 902 aa20.51■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 NBPF15Q8N660 670 aa20.51■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 RPS6KA4O75676 772 aa20.51■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.51■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.5■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 SMIM5Q71RC9 77 aa20.5■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.5■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.5■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.5■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 ERBB4Q15303 1308 aa20.49■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 ANXA1P04083 346 aa20.49■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 MYL6BP14649 208 aa20.49■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 PDIA6Q15084 440 aa20.49■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 PHF14O94880 888 aa20.48■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 PROSER3Q2NL68 480 aa20.48■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 STK31Q9BXU1 1019 aa20.46■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RAI1-204ENST00000489697 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.45■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 SSFA2P28290 1259 aa20.45■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.45■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.45■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 SLC4A2P04920 1241 aa20.44■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.44■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 ZNF428Q96B54 188 aa20.44■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 COL15A1P39059 1388 aa20.44■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 ADRA2BP18089 450 aa20.43■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.43■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 ARXQ96QS3 562 aa20.43■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 HYPKQ9NX55 129 aa20.43■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.42■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.42■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 A0A087WZG4 1122 aa20.42■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 MSH5O43196 834 aa20.42■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.42■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.42■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.42■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 RFC4P35249 363 aa20.41■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.41■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 COPS6Q7L5N1 327 aa20.41■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.41■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 G2E3Q7L622 706 aa20.4■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.4■□□□□ 0.86
RAI1-204ENST00000489697 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RAI1-204ENST00000489697 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RAI1-204ENST00000489697 NARFQ9UHQ1 456 aa20.38■□□□□ 0.85
RAI1-204ENST00000489697 ZPR1O75312 459 aa20.38■□□□□ 0.85
RAI1-204ENST00000489697 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.38■□□□□ 0.85
RAI1-204ENST00000489697 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.37■□□□□ 0.85
RAI1-204ENST00000489697 FLIIQ13045 1269 aa20.37■□□□□ 0.85
RAI1-204ENST00000489697 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RAI1-204ENST00000489697 CACNA1FO60840 1977 aa20.36■□□□□ 0.85
RAI1-204ENST00000489697 BCAR3O75815 825 aa20.36■□□□□ 0.85
RAI1-204ENST00000489697 CAMTA2O94983 1202 aa20.36■□□□□ 0.85
RAI1-204ENST00000489697 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.3 ms