RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484147.5

PTPN22-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, human

TSL 2

Gene PTPN22, Length 2,258 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN22-205	ENST00000484147	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	VPS72	Q15906	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	EEA1	Q15075	1411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	APBA3	O96018	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	TREML4	Q6UXN2	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	KDM4A	O75164	1064 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	KCNJ4	P48050	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ABCA6	Q8N139	1617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	DYNC1I1	O14576	645 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ADAMTS2	O95450	1211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	MTA1	Q13330	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	MKL1	Q969V6	931 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	CACNA1G	O43497	2377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	LHX6	Q9UPM6	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	IGF1R	P08069	1367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	TNR	Q92752	1358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	DCC	P43146	1447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	POGK	Q9P215	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	MYOM2	P54296	1465 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	SOBP	A7XYQ1	873 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	POLD1	P28340	1107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	MICALL2	Q8IY33	904 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	GOLGA3	Q08378	1498 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PTPN22-205	ENST00000484147	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PTPN22-205	ENST00000484147	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
PTPN22-205	ENST00000484147	SETDB1	Q15047	1291 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PTPN22-205	ENST00000484147	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PTPN22-205	ENST00000484147	BACH2	Q9BYV9	841 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PTPN22-205	ENST00000484147	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PTPN22-205	ENST00000484147	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTPN22-205	ENST00000484147	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTPN22-205	ENST00000484147	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN22-205	ENST00000484147	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN22-205	ENST00000484147	VEGFB	P49765	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN22-205	ENST00000484147	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN22-205	ENST00000484147	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN22-205	ENST00000484147	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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