RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 SYT17Q9BSW7 474 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP4-209ENST00000484097 NEUROD2Q15784 382 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP4-209ENST00000484097 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP4-209ENST00000484097 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SH3BP4-209ENST00000484097 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP4-209ENST00000484097 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SH3BP4-209ENST00000484097 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SH3BP4-209ENST00000484097 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP4-209ENST00000484097 ZPR1O75312 459 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP4-209ENST00000484097 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SH3BP4-209ENST00000484097 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SH3BP4-209ENST00000484097 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 GYS1P13807 737 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC184Q52MB2 194 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 MRS2Q9HD23 443 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 MMP10P09238 476 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 USP16Q9Y5T5 823 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 C4AP0C0L4 1744 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A087WZG4 1122 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 COL15A1P39059 1388 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 A1BGP04217 495 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 NARFQ9UHQ1 456 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP4-209ENST00000484097 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP4-209ENST00000484097 APAF1O14727 1248 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP4-209ENST00000484097 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SH3BP4-209ENST00000484097 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SH3BP4-209ENST00000484097 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP4-209ENST00000484097 FKBP8Q14318 412 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP4-209ENST00000484097 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SH3BP4-209ENST00000484097 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP4-209ENST00000484097 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR162Q16538 588 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP4-209ENST00000484097 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 TM4SF1P30408 202 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 CHL1O00533 1208 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 NBPF26B4DH59 902 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 DDR1Q08345 913 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 NFIXQ14938 502 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 NBPF15Q8N660 670 aa25.14■■□□□ 1.62
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SH3BP4-209ENST00000484097 TGFB2P61812 414 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 NGEFQ8N5V2 710 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 CAMTA2O94983 1202 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 SERPINB2P05120 415 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 MYL6BP14649 208 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 GNAI1P63096 354 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 IFT57Q9NWB7 429 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 ERBB4Q15303 1308 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 GRIN3BO60391 1043 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 SETDB2Q96T68 719 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 MBIPQ9NS73 344 aa25.07■■□□□ 1.6
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SH3BP4-209ENST00000484097 A0A0G2JLW4 131 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF853P0CG23 659 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC27Q2M243 656 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 NPHP1O15259 732 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 KRT24Q2M2I5 525 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 NECTIN2Q92692 538 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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SH3BP4-209ENST00000484097 DPEP1P16444 411 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 YY1P25490 414 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 RGL2O15211 777 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 WWC1Q8IX03 1113 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 CHD4Q14839 1912 aa25.02■■□□□ 1.6
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