RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-204ENST00000476612 KLHL34Q8N239 644 aa5.3□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 NBPF15Q8N660 670 aa5.3□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.3□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 TRIM35Q9UPQ4 493 aa5.3□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 UBR3Q6ZT12 1888 aa5.3□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 HEG1Q9ULI3 1381 aa5.29□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 SCN11AQ9UI33 1791 aa5.29□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 QSER1Q2KHR3 1735 aa5.29□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 A0A0G2JLW4 131 aa5.29□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 RIPK4P57078 832 aa5.29□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 NFIXQ14938 502 aa5.29□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 GPR162Q16538 588 aa5.29□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 FMNL2Q96PY5 1086 aa5.29□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 NARFQ9UHQ1 456 aa5.29□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa5.29□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 TJP1Q07157 1748 aa5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF831Q5JPB2 1677 aa5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 CAMTA2O94983 1202 aa5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 STARD3NLO95772 234 aa5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 DPEP1P16444 411 aa5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 YY1P25490 414 aa5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 KRT24Q2M2I5 525 aa5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 TBC1D9BQ66K14 1250 aa5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 LRP10Q7Z4F1 713 aa5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 TTC5Q8N0Z6 440 aa5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 PARP3Q9Y6F1 533 aa5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1-204ENST00000476612 CHL1O00533 1208 aa5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZPR1O75312 459 aa5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 TGFB2P61812 414 aa5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 PDIA6Q15084 440 aa5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 NEUROD2Q15784 382 aa5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 HLFQ16534 295 aa5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCDC24Q8N4L8 307 aa5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 RUNDC1Q96C34 613 aa5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 COL15A1P39059 1388 aa5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 PXDNLA1KZ92 1463 aa5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 C10orf71Q711Q0 1435 aa5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 APAF1O14727 1248 aa5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 SERPINB2P05120 415 aa5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF853P0CG23 659 aa5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 CHRNA5P30532 468 aa5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 PRELPP51888 382 aa5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 PROSER3Q2NL68 480 aa5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 BICDL1Q6ZP65 573 aa5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 CARMIL3Q8ND23 1372 aa5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 UBR2Q8IWV8 1755 aa5.25□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 GRIN3BO60391 1043 aa5.25□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 ANXA1P04083 346 aa5.25□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 PRR5LQ6MZQ0 368 aa5.25□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 NGEFQ8N5V2 710 aa5.25□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 TSPYL4Q9UJ04 414 aa5.25□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa5.24□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 A0A087WZG4 1122 aa5.24□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 DCAF8L1A6NGE4 600 aa5.24□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP5.24□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 CLEC4GQ6UXB4 293 aa5.24□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 NECTIN2Q92692 538 aa5.24□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 BCS1LQ9Y276 419 aa5.24□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 C4AP0C0L4 1744 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 NEFMP07197 916 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 MYL6BP14649 208 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC51AQ86UW1 340 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF34Q8IZ26 560 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 TSPYL6Q8N831 410 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 C7orf43Q8WVR3 580 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 CFAP44Q96MT7 982 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 SETDB2Q96T68 719 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 MBIPQ9NS73 344 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 BABAM1Q9NWV8 329 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 PIM2Q9P1W9 311 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 UBN2Q6ZU65 1347 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 ADCY9O60503 1353 aa5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 FAM177BA6PVY3 158 aa5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 ERVV-1B6SEH8 477 aa5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 151.6 ms