RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468358.5

CLDN11-202, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 3

Gene CLDN11, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-202ENST00000468358 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.81■■□□□ 1.24
CLDN11-202ENST00000468358 SYT17Q9BSW7 474 aa22.81■■□□□ 1.24
CLDN11-202ENST00000468358 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CLDN11-202ENST00000468358 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.81■■□□□ 1.24
CLDN11-202ENST00000468358 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.8■■□□□ 1.24
CLDN11-202ENST00000468358 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CLDN11-202ENST00000468358 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.8■■□□□ 1.24
CLDN11-202ENST00000468358 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CLDN11-202ENST00000468358 CCDC184Q52MB2 194 aa22.78■■□□□ 1.24
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CLDN11-202ENST00000468358 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.77■■□□□ 1.24
CLDN11-202ENST00000468358 MRS2Q9HD23 443 aa22.77■■□□□ 1.24
CLDN11-202ENST00000468358 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CLDN11-202ENST00000468358 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CLDN11-202ENST00000468358 COL15A1P39059 1388 aa22.76■■□□□ 1.23
CLDN11-202ENST00000468358 ZPR1O75312 459 aa22.76■■□□□ 1.23
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CLDN11-202ENST00000468358 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.76■■□□□ 1.23
CLDN11-202ENST00000468358 MMP10P09238 476 aa22.75■■□□□ 1.23
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CLDN11-202ENST00000468358 GYS1P13807 737 aa22.75■■□□□ 1.23
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CLDN11-202ENST00000468358 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.74■■□□□ 1.23
CLDN11-202ENST00000468358 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.73■■□□□ 1.23
CLDN11-202ENST00000468358 USP16Q9Y5T5 823 aa22.73■■□□□ 1.23
CLDN11-202ENST00000468358 A1BGP04217 495 aa22.72■■□□□ 1.23
CLDN11-202ENST00000468358 APAF1O14727 1248 aa22.71■■□□□ 1.23
CLDN11-202ENST00000468358 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.71■■□□□ 1.23
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CLDN11-202ENST00000468358 FKBP8Q14318 412 aa22.7■■□□□ 1.22
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CLDN11-202ENST00000468358 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.7■■□□□ 1.22
CLDN11-202ENST00000468358 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.7■■□□□ 1.22
CLDN11-202ENST00000468358 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.7■■□□□ 1.22
CLDN11-202ENST00000468358 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CLDN11-202ENST00000468358 NARFQ9UHQ1 456 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN11-202ENST00000468358 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN11-202ENST00000468358 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
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CLDN11-202ENST00000468358 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN11-202ENST00000468358 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.66■■□□□ 1.22
CLDN11-202ENST00000468358 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.65■■□□□ 1.22
CLDN11-202ENST00000468358 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CLDN11-202ENST00000468358 GPR162Q16538 588 aa22.65■■□□□ 1.22
CLDN11-202ENST00000468358 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.64■■□□□ 1.21
CLDN11-202ENST00000468358 SCN7AQ01118 1682 aa22.63■■□□□ 1.21
CLDN11-202ENST00000468358 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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CLDN11-202ENST00000468358 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.62■■□□□ 1.21
CLDN11-202ENST00000468358 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.61■■□□□ 1.21
CLDN11-202ENST00000468358 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.61■■□□□ 1.21
CLDN11-202ENST00000468358 NBPF26B4DH59 902 aa22.6■■□□□ 1.21
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CLDN11-202ENST00000468358 NBPF15Q8N660 670 aa22.6■■□□□ 1.21
CLDN11-202ENST00000468358 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.6■■□□□ 1.21
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CLDN11-202ENST00000468358 BCORQ6W2J9 1755 aa22.59■■□□□ 1.21
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CLDN11-202ENST00000468358 TM4SF1P30408 202 aa22.59■■□□□ 1.21
CLDN11-202ENST00000468358 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.59■■□□□ 1.21
CLDN11-202ENST00000468358 MYL6BP14649 208 aa22.58■■□□□ 1.21
CLDN11-202ENST00000468358 CFAP44Q96MT7 982 aa22.58■■□□□ 1.21
CLDN11-202ENST00000468358 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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CLDN11-202ENST00000468358 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.56■■□□□ 1.2
CLDN11-202ENST00000468358 SERPINB2P05120 415 aa22.55■■□□□ 1.2
CLDN11-202ENST00000468358 GNAI1P63096 354 aa22.55■■□□□ 1.2
CLDN11-202ENST00000468358 KRT24Q2M2I5 525 aa22.55■■□□□ 1.2
CLDN11-202ENST00000468358 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CLDN11-202ENST00000468358 NPHP1O15259 732 aa22.54■■□□□ 1.2
CLDN11-202ENST00000468358 TGFB2P61812 414 aa22.54■■□□□ 1.2
CLDN11-202ENST00000468358 MBIPQ9NS73 344 aa22.54■■□□□ 1.2
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CLDN11-202ENST00000468358 ERBB4Q15303 1308 aa22.54■■□□□ 1.2
CLDN11-202ENST00000468358 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.54■■□□□ 1.2
CLDN11-202ENST00000468358 A0A0G2JLW4 131 aa22.53■■□□□ 1.2
CLDN11-202ENST00000468358 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
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CLDN11-202ENST00000468358 SETDB2Q96T68 719 aa22.53■■□□□ 1.2
CLDN11-202ENST00000468358 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.52■■□□□ 1.2
CLDN11-202ENST00000468358 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.52■■□□□ 1.2
CLDN11-202ENST00000468358 DPEP1P16444 411 aa22.51■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.51■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 GRIN3BO60391 1043 aa22.5■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 ANXA1P04083 346 aa22.5■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF853P0CG23 659 aa22.5■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 YY1P25490 414 aa22.5■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 CCDC27Q2M243 656 aa22.5■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.5■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 CHD4Q14839 1912 aa22.5■■□□□ 1.19
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