RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461648.2

TSC2-208, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 2

Gene TSC2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-208	ENST00000461648	USP16	Q9Y5T5	823 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TSC2-208	ENST00000461648	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TSC2-208	ENST00000461648	KRT24	Q2M2I5	525 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TSC2-208	ENST00000461648	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TSC2-208	ENST00000461648	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		33.06	■■■□□ 2.88
TSC2-208	ENST00000461648	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		33.06	■■■□□ 2.88
TSC2-208	ENST00000461648	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		33.06	■■■□□ 2.88
TSC2-208	ENST00000461648		E9PSI1	815 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TSC2-208	ENST00000461648	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
TSC2-208	ENST00000461648	GNPAT	O15228	680 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TSC2-208	ENST00000461648	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		33.03	■■■□□ 2.88
TSC2-208	ENST00000461648	SLFN5	Q08AF3	891 aa		33.03	■■■□□ 2.88
TSC2-208	ENST00000461648	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
TSC2-208	ENST00000461648	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		33.03	■■■□□ 2.88
TSC2-208	ENST00000461648	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		33.03	■■■□□ 2.88
TSC2-208	ENST00000461648	HOXB7	P09629	217 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TSC2-208	ENST00000461648	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TSC2-208	ENST00000461648	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		33.01	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	RPS6KA4	O75676	772 aa		33	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	A1BG	P04217	495 aa		33	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	SSFA2	P28290	1259 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	TSPYL6	Q8N831	410 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	PHF14	O94880	888 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	SMIM5	Q71RC9	77 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
TSC2-208	ENST00000461648	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	NECTIN2	Q92692	538 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	ERBB4	Q15303	1308 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	NBPF26	B4DH59	902 aa		32.93	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	ADRA2B	P18089	450 aa		32.93	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	NBPF15	Q8N660	670 aa		32.93	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	CASZ1	Q86V15	1759 aa		32.93	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		32.92	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	C4A	P0C0L4	1744 aa		32.91	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	COL15A1	P39059	1388 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	MSH5	O43196	834 aa		32.89	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		32.89	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
TSC2-208	ENST00000461648	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
TSC2-208	ENST00000461648	VAMP4	O75379	141 aa		32.87	■■■□□ 2.85
TSC2-208	ENST00000461648	PDIA6	Q15084	440 aa		32.87	■■■□□ 2.85
TSC2-208	ENST00000461648	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
TSC2-208	ENST00000461648		A0A087WZG4	1122 aa		32.86	■■■□□ 2.85
TSC2-208	ENST00000461648	MYL6B	P14649	208 aa		32.86	■■■□□ 2.85
TSC2-208	ENST00000461648	RFC4	P35249	363 aa		32.86	■■■□□ 2.85
TSC2-208	ENST00000461648	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		32.86	■■■□□ 2.85
TSC2-208	ENST00000461648	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	32.86	■■■□□ 2.85
TSC2-208	ENST00000461648	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		32.86	■■■□□ 2.85
TSC2-208	ENST00000461648	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
TSC2-208	ENST00000461648	PROSER3	Q2NL68	480 aa		32.84	■■■□□ 2.85
TSC2-208	ENST00000461648	ANXA1	P04083	346 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TSC2-208	ENST00000461648	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		32.82	■■■□□ 2.84
TSC2-208	ENST00000461648	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		32.81	■■■□□ 2.84
TSC2-208	ENST00000461648	NARF	Q9UHQ1	456 aa		32.8	■■■□□ 2.84
TSC2-208	ENST00000461648	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
TSC2-208	ENST00000461648	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
TSC2-208	ENST00000461648	ARX	Q96QS3	562 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TSC2-208	ENST00000461648	STK31	Q9BXU1	1019 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TSC2-208	ENST00000461648	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
TSC2-208	ENST00000461648	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TSC2-208	ENST00000461648	CACNA1F	O60840	1977 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TSC2-208	ENST00000461648	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
TSC2-208	ENST00000461648	ZPR1	O75312	459 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TSC2-208	ENST00000461648	HYPK	Q9NX55	129 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TSC2-208	ENST00000461648	SCN7A	Q01118	1682 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TSC2-208	ENST00000461648	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TSC2-208	ENST00000461648	ZBTB7A	O95365	584 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	MTFR1L	Q9H019	292 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	CAMTA2	O94983	1202 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	GYS1	P13807	737 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	COPS6	Q7L5N1	327 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF428	Q96B54	188 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	SLC4A2	P04920	1241 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	MSL1	Q68DK7	614 aa		32.72	■■■□□ 2.83

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