RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 FMNL2Q96PY5 1086 aa31.66■■■□□ 2.66
SH3BP5-208ENST00000459627 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa31.65■■■□□ 2.66
SH3BP5-208ENST00000459627 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
SH3BP5-208ENST00000459627 FKBP8Q14318 412 aa31.63■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR162Q16538 588 aa31.63■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 NLGN1Q8N2Q7 840 aa31.63■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 WWC3Q9ULE0 1092 aa31.63■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 COL15A1P39059 1388 aa31.61■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 STARD3NLO95772 234 aa31.61■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 USPL1Q5W0Q7 1092 aa31.61■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 CD2APQ9Y5K6 639 aa31.61■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 A1BGP04217 495 aa31.6■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP31.6■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 ADAMTS8Q9UP79 889 aa31.59■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 USP16Q9Y5T5 823 aa31.59■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 RIPK4P57078 832 aa31.58■■■□□ 2.65
SH3BP5-208ENST00000459627 ZPR1O75312 459 aa31.57■■■□□ 2.64
SH3BP5-208ENST00000459627 NEUROD2Q15784 382 aa31.57■■■□□ 2.64
SH3BP5-208ENST00000459627 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP31.56■■■□□ 2.64
SH3BP5-208ENST00000459627 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
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SH3BP5-208ENST00000459627 DDR1Q08345 913 aa31.55■■■□□ 2.64
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC184Q52MB2 194 aa31.55■■■□□ 2.64
SH3BP5-208ENST00000459627 PARP3Q9Y6F1 533 aa31.55■■■□□ 2.64
SH3BP5-208ENST00000459627 UTRNP46939 3433 aa31.55■■■□□ 2.64
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SH3BP5-208ENST00000459627 EIF5P55010 431 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
SH3BP5-208ENST00000459627 NARFQ9UHQ1 456 aa31.54■■■□□ 2.64
SH3BP5-208ENST00000459627 BCL2L12Q9HB09 334 aa31.53■■■□□ 2.64
SH3BP5-208ENST00000459627 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa31.52■■■□□ 2.64
SH3BP5-208ENST00000459627 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
SH3BP5-208ENST00000459627 RUNDC1Q96C34 613 aa31.51■■■□□ 2.63
SH3BP5-208ENST00000459627 KDM3BQ7LBC6 1761 aa31.51■■■□□ 2.63
SH3BP5-208ENST00000459627 TM4SF1P30408 202 aa31.49■■■□□ 2.63
SH3BP5-208ENST00000459627 C10orf71Q711Q0 1435 aa31.49■■■□□ 2.63
SH3BP5-208ENST00000459627 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
SH3BP5-208ENST00000459627 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
SH3BP5-208ENST00000459627 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
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SH3BP5-208ENST00000459627 BICDL1Q6ZP65 573 aa31.47■■■□□ 2.63
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SH3BP5-208ENST00000459627 A0A0G2JLW4 131 aa31.46■■■□□ 2.63
SH3BP5-208ENST00000459627 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
SH3BP5-208ENST00000459627 KIF13BQ9NQT8 1826 aa31.46■■■□□ 2.63
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa31.46■■■□□ 2.63
SH3BP5-208ENST00000459627 PXDNLA1KZ92 1463 aa31.46■■■□□ 2.63
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A087WZG4 1122 aa31.45■■■□□ 2.63
SH3BP5-208ENST00000459627 NBPF26B4DH59 902 aa31.43■■■□□ 2.62
SH3BP5-208ENST00000459627 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
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SH3BP5-208ENST00000459627 TSPYL4Q9UJ04 414 aa31.43■■■□□ 2.62
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM35Q9UPQ4 493 aa31.43■■■□□ 2.62
SH3BP5-208ENST00000459627 DPEP1P16444 411 aa31.42■■■□□ 2.62
SH3BP5-208ENST00000459627 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa31.41■■■□□ 2.62
SH3BP5-208ENST00000459627 TBC1D9BQ66K14 1250 aa31.41■■■□□ 2.62
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SH3BP5-208ENST00000459627 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
SH3BP5-208ENST00000459627 LMOD3Q0VAK6 560 aa31.4■■■□□ 2.62
SH3BP5-208ENST00000459627 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
SH3BP5-208ENST00000459627 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
SH3BP5-208ENST00000459627 SCN7AQ01118 1682 aa31.4■■■□□ 2.62
SH3BP5-208ENST00000459627 CHD4Q14839 1912 aa31.39■■■□□ 2.62
SH3BP5-208ENST00000459627 LAMB4A4D0S4 1761 aa31.39■■■□□ 2.62
SH3BP5-208ENST00000459627 CAMTA2O94983 1202 aa31.39■■■□□ 2.62
SH3BP5-208ENST00000459627 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
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SH3BP5-208ENST00000459627 APAF1O14727 1248 aa31.37■■■□□ 2.61
SH3BP5-208ENST00000459627 TGFB2P61812 414 aa31.37■■■□□ 2.61
SH3BP5-208ENST00000459627 NGEFQ8N5V2 710 aa31.37■■■□□ 2.61
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SH3BP5-208ENST00000459627 CARMIL3Q8ND23 1372 aa31.33■■■□□ 2.61
SH3BP5-208ENST00000459627 MYL6BP14649 208 aa31.32■■■□□ 2.6
SH3BP5-208ENST00000459627 KRT24Q2M2I5 525 aa31.32■■■□□ 2.6
SH3BP5-208ENST00000459627 NRXN2Q9P2S2 1712 aa31.32■■■□□ 2.6
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
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SH3BP5-208ENST00000459627 MRS2Q9HD23 443 aa31.3■■■□□ 2.6
SH3BP5-208ENST00000459627 CHL1O00533 1208 aa31.28■■■□□ 2.6
SH3BP5-208ENST00000459627 HLFQ16534 295 aa31.27■■■□□ 2.6
SH3BP5-208ENST00000459627 TTLL7Q6ZT98 887 aa31.27■■■□□ 2.6
SH3BP5-208ENST00000459627 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
SH3BP5-208ENST00000459627 ANXA1P04083 346 aa31.26■■■□□ 2.59
SH3BP5-208ENST00000459627 SETDB2Q96T68 719 aa31.26■■■□□ 2.59
SH3BP5-208ENST00000459627 BABAM1Q9NWV8 329 aa31.26■■■□□ 2.59
SH3BP5-208ENST00000459627 PRR5LQ6MZQ0 368 aa31.25■■■□□ 2.59
SH3BP5-208ENST00000459627 PIM2Q9P1W9 311 aa31.24■■■□□ 2.59
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM177BA6PVY3 158 aa31.23■■■□□ 2.59
SH3BP5-208ENST00000459627 PROSER3Q2NL68 480 aa31.23■■■□□ 2.59
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