RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445150.3

SRP19-202, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP19, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-202ENST00000445150 WDR63Q8IWG1 891 aa22.89■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 WWC1Q8IX03 1113 aa22.89■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.88■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 IL16Q14005 1332 aa22.87■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 RFC4P35249 363 aa22.87■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.87■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 A0A087WZG4 1122 aa22.86■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 TJP1Q07157 1748 aa22.85■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 ZBTB7AO95365 584 aa22.85■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 ZNF853P0CG23 659 aa22.85■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 USP16Q9Y5T5 823 aa22.85■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 POLD1P28340 1107 aa22.84■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.84■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 HOXB7P09629 217 aa22.83■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.83■■□□□ 1.25
SRP19-202ENST00000445150 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 CASZ1Q86V15 1759 aa22.82■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 ZPR1O75312 459 aa22.82■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 MBIPQ9NS73 344 aa22.82■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 ERBB4Q15303 1308 aa22.82■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 A1BGP04217 495 aa22.81■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.81■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.8■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.79■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 COL15A1P39059 1388 aa22.78■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.78■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.78■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.78■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 NARFQ9UHQ1 456 aa22.77■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SRP19-202ENST00000445150 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.76■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 GOLGA2Q08379 1002 aa22.76■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 SMIM5Q71RC9 77 aa22.76■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 ARXQ96QS3 562 aa22.76■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.75■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 LRP5O75197 1615 aa22.75■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 PTGER2P43116 358 aa22.74■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 GYS1P13807 737 aa22.73■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.73■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 RGL2O15211 777 aa22.72■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.72■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 MSL1Q68DK7 614 aa22.72■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.72■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.71■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 NBPF26B4DH59 902 aa22.71■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 NBPF15Q8N660 670 aa22.71■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.71■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 ZNF521Q96K83 1311 aa22.71■■□□□ 1.23
SRP19-202ENST00000445150 E9PSI1 815 aa22.7■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 MYL6BP14649 208 aa22.7■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 KRT24Q2M2I5 525 aa22.7■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.7■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.7■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.69■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.69■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.69■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.68■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.68■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.67■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 MMP10P09238 476 aa22.67■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 NECTIN2Q92692 538 aa22.67■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 HYPKQ9NX55 129 aa22.67■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 FKBP8Q14318 412 aa22.66■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 CAMTA2O94983 1202 aa22.65■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 STK31Q9BXU1 1019 aa22.65■■□□□ 1.22
SRP19-202ENST00000445150 TM4SF1P30408 202 aa22.64■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 PDIA6Q15084 440 aa22.64■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.64■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.64■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.63■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 C4AP0C0L4 1744 aa22.63■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 SLFN5Q08AF3 891 aa22.62■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 TSPYL6Q8N831 410 aa22.62■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 SETDB2Q96T68 719 aa22.62■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms