RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418207.1

RPSAP9-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP9, Length 888 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP9-201ENST00000418207 STARD3NLO95772 234 aa13.68□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 RFC4P35249 363 aa13.68□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 C4AP0C0L4 1744 aa13.67□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 LMOD3Q0VAK6 560 aa13.67□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 CCDC184Q52MB2 194 aa13.67□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 KLHL34Q8N239 644 aa13.67□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 MIS18AQ9NYP9 233 aa13.67□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 HEG1Q9ULI3 1381 aa13.67□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 MRS2Q9HD23 443 aa13.66□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.65□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 KDM3BQ7LBC6 1761 aa13.65□□□□□ -0.22
RPSAP9-201ENST00000418207 CANXP27824 592 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 ZPR1O75312 459 aa13.63□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 NLGN1Q8N2Q7 840 aa13.63□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 SYT17Q9BSW7 474 aa13.63□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa13.63□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 APAF1O14727 1248 aa13.62□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 TSPYL4Q9UJ04 414 aa13.62□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 COL15A1P39059 1388 aa13.61□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa13.61□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 A1BGP04217 495 aa13.61□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 MMP10P09238 476 aa13.61□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 GYS1P13807 737 aa13.61□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 TRIM35Q9UPQ4 493 aa13.61□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 USP16Q9Y5T5 823 aa13.61□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 SLC4A2P04920 1241 aa13.6□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 LAMB4A4D0S4 1761 aa13.6□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 A0A087WZG4 1122 aa13.59□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 EIF5P55010 431 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 FKBP8Q14318 412 aa13.59□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 USPL1Q5W0Q7 1092 aa13.59□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 PARP3Q9Y6F1 533 aa13.59□□□□□ -0.23
RPSAP9-201ENST00000418207 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 BABAM1Q9NWV8 329 aa13.58□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 NARFQ9UHQ1 456 aa13.58□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa13.57□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 NLGN2Q8NFZ4 835 aa13.57□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa13.57□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 FAM9BQ8IZU0 186 aa13.56□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 CD2APQ9Y5K6 639 aa13.56□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 CHL1O00533 1208 aa13.55□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 SCN7AQ01118 1682 aa13.54□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 NBPF26B4DH59 902 aa13.54□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 GPR162Q16538 588 aa13.54□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 BICDL1Q6ZP65 573 aa13.54□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 NGEFQ8N5V2 710 aa13.54□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 NBPF15Q8N660 670 aa13.54□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 KIF13BQ9NQT8 1826 aa13.54□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 TM4SF1P30408 202 aa13.53□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 DDR1Q08345 913 aa13.53□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 CFAP44Q96MT7 982 aa13.53□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 BCL2L12Q9HB09 334 aa13.53□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 BCORQ6W2J9 1755 aa13.53□□□□□ -0.24
RPSAP9-201ENST00000418207 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 MYL6BP14649 208 aa13.52□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 GNAI1P63096 354 aa13.52□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 NFIXQ14938 502 aa13.52□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 NECTIN2Q92692 538 aa13.52□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 CHD4Q14839 1912 aa13.51□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 CAMTA2O94983 1202 aa13.51□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 KRT24Q2M2I5 525 aa13.51□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 TBC1D9BQ66K14 1250 aa13.51□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 MBIPQ9NS73 344 aa13.51□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 IFT57Q9NWB7 429 aa13.51□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 NUP98P52948 1817 aa13.5□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 ZBTB22O15209 634 aa13.5□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 SERPINB2P05120 415 aa13.5□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 SETDB2Q96T68 719 aa13.5□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 WWC3Q9ULE0 1092 aa13.5□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 ZNF652Q9Y2D9 606 aa13.5□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 C10orf71Q711Q0 1435 aa13.49□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 ERBB4Q15303 1308 aa13.49□□□□□ -0.25
RPSAP9-201ENST00000418207 A0A0G2JLW4 131 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms