RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MCM10Q7L590 875 aa11.27□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.27□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A087WZG4 1122 aa11.26□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHF14O94880 888 aa11.26□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RFC4P35249 363 aa11.26□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNAJC10Q8IXB1 793 aa11.26□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGL2O15211 777 aa11.25□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RIPK4P57078 832 aa11.25□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11.25□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL15A1P39059 1388 aa11.25□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCN7AQ01118 1682 aa11.24□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF13BQ9NQT8 1826 aa11.24□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZPR1O75312 459 aa11.23□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NGEFQ8N5V2 710 aa11.23□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.23□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERBB4Q15303 1308 aa11.23□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GYS1P13807 737 aa11.22□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EIF5P55010 431 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DCTN1Q14203 1278 aa11.22□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BCORQ6W2J9 1755 aa11.22□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.22□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SYT17Q9BSW7 474 aa11.22□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRS2Q9HD23 443 aa11.22□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NARFQ9UHQ1 456 aa11.22□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa11.22□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.21□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TSPYL4Q9UJ04 414 aa11.21□□□□□ -0.61
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.2□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MMP10P09238 476 aa11.2□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HOXB7P09629 217 aa11.2□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC27Q2M243 656 aa11.2□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MSL1Q68DK7 614 aa11.2□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.2□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.2□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NRXN2Q9P2S2 1712 aa11.19□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.19□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHL1O00533 1208 aa11.18□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNQ3O43525 872 aa11.18□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CANXP27824 592 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLEC4GQ6UXB4 293 aa11.18□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CFAP44Q96MT7 982 aa11.18□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.18□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IFT57Q9NWB7 429 aa11.18□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF652Q9Y2D9 606 aa11.18□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHD4Q14839 1912 aa11.17□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 APAF1O14727 1248 aa11.17□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TGFB2P61812 414 aa11.17□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GNAI1P63096 354 aa11.17□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NEUROD2Q15784 382 aa11.17□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USPL1Q5W0Q7 1092 aa11.17□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP16Q9Y5T5 823 aa11.17□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CARMIL3Q8ND23 1372 aa11.16□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL16Q14005 1332 aa11.16□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa11.16□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GRIN3BO60391 1043 aa11.15□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A1BGP04217 495 aa11.15□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TM4SF1P30408 202 aa11.15□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FKBP8Q14318 412 aa11.15□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLHL34Q8N239 644 aa11.15□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa11.15□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.14□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCER2I3L3R5 266 aa11.14□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF853P0CG23 659 aa11.14□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMIM5Q71RC9 77 aa11.14□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MIS18AQ9NYP9 233 aa11.14□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DLEC1Q9Y238 1755 aa11.13□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PXDNLA1KZ92 1463 aa11.13□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP10DQ9P241 1426 aa11.13□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAMTA2O94983 1202 aa11.13□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NFIXQ14938 502 aa11.13□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC184Q52MB2 194 aa11.13□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF6Q6ZMV9 814 aa11.13□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.13□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CACNA1FO60840 1977 aa11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms