RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411257.1

RNU6-177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-177P-201ENST00000411257 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 CRISPLD1Q9H336 500 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 PARP3Q9Y6F1 533 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 USP3Q9Y6I4 520 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 TMEM229AB2RXF0 380 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 GNB5O14775 395 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 ARAFP10398 606 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 DGKGP49619 791 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 SMTNP53814 917 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 TNP2Q05952 138 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 CHSY3Q70JA7 882 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 NLRP8Q86W28 1048 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 FCHSD1Q86WN1 690 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 TRIM11Q96F44 468 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZIC5Q96T25 663 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 SEMA6BQ9H3T3 888 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 GDPD2Q9HCC8 539 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 STRN4Q9NRL3 753 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 CHIC2Q9UKJ5 165 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 SOCS7O14512 581 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 FIGNL1Q6PIW4 674 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 PLVAPQ9BX97 442 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 CABP1Q9NZU7 370 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 A6NJY4 79 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 PIK3CDO00329 1044 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 CDK2AP1O14519 115 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 TXLNAP40222 546 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 ABL2P42684 1182 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 TBCELQ5QJ74 424 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 PLPP7Q8NBV4 271 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 C1orf216Q8TAB5 229 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 SIRT1Q96EB6 747 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLC4A9Q96Q91 983 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRR12Q9ULL5 1215 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-177P-201ENST00000411257 APBB1O00213 710 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 ADH6P28332 368 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 GATA4P43694 442 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 SEMA3FQ13275 785 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 MTFR1Q15390 333 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 MAP7D1Q3KQU3 841 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM182BQ5T319 152 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 BICDL1Q6ZP65 573 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 C8orf86Q6ZUL3 223 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRM3Q9NNZ6 103 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 MARK1Q9P0L2 795 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 GJA3Q9Y6H8 435 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM229AH3BQW9 127 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 PIK3R2O00459 728 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 TATP17735 454 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 SYT9Q86SS6 491 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 C7orf43Q8WVR3 580 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 L3MBTL2Q969R5 705 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLC30A3Q99726 388 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 EFSO43281 561 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM157BP0CG42 384 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 SKIP12755 728 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 ALAS2P22557 587 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 NOS2P35228 1153 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 GRIK4Q16099 956 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 NBPF1Q3BBV0 1214 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 ELOA3BQ3SY89 546 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 TNS4Q8IZW8 715 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 DEPDC4Q8N2C3 294 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 ELOA3Q8NG57 546 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 STARD13Q9Y3M8 1113 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 EML1O00423 815 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 BACH1O14867 736 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-177P-201ENST00000411257 GTF2IP78347 998 aa2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms