RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CCL20-202ENST00000409189 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CCL20-202ENST00000409189 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa10.36□□□□□ -0.75
CCL20-202ENST00000409189 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CCL20-202ENST00000409189 RNFT1Q5M7Z0 435 aa10.35□□□□□ -0.75
CCL20-202ENST00000409189 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CCL20-202ENST00000409189 TRIM52Q96A61 297 aa10.35□□□□□ -0.75
CCL20-202ENST00000409189 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa10.35□□□□□ -0.75
CCL20-202ENST00000409189 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa10.35□□□□□ -0.75
CCL20-202ENST00000409189 CYLDQ9NQC7 956 aa10.35□□□□□ -0.75
CCL20-202ENST00000409189 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CCL20-202ENST00000409189 MTMR14Q8NCE2 650 aa10.34□□□□□ -0.75
CCL20-202ENST00000409189 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa10.34□□□□□ -0.75
CCL20-202ENST00000409189 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa10.33□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 ERVK-9P63128 1117 aa10.33□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 NR1H3Q13133 447 aa10.33□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 PRXQ9BXM0 1461 aa10.33□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa10.32□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 VWA5B2Q8N398 1253 aa10.32□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa10.32□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 SLURP2P0DP57 97 aa10.31□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 GPC1P35052 558 aa10.31□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 SV2AQ7L0J3 742 aa10.31□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa10.31□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa10.3□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 POTEAQ6S8J7 498 aa10.3□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 CEP162Q5TB80 1403 aa10.3□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 TOM1O60784 492 aa10.29□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 RNF20Q5VTR2 975 aa10.29□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa10.29□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 ZNF592Q92610 1267 aa10.29□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 CDC14CA4D256 554 aa10.28□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 PLEKHD1A6NEE1 506 aa10.28□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa10.28□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 SAMD9Q5K651 1589 aa10.27□□□□□ -0.76
CCL20-202ENST00000409189 PLCH2O75038 1416 aa10.27□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 ABCA6Q8N139 1617 aa10.27□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 AFAP1Q8N556 730 aa10.27□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa10.27□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 ADAMTS8Q9UP79 889 aa10.27□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 PLA2R1Q13018 1463 aa10.27□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 KDM5CP41229 1560 aa10.26□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 REREQ9P2R6 1566 aa10.26□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PRU2 124 aa10.26□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 TRAK2O60296 914 aa10.26□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 KANK3Q6NY19 840 aa10.26□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 SNRKQ9NRH2 765 aa10.26□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 AGLP35573 1532 aa10.26□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 SCTRP47872 440 aa10.25□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa10.25□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 NPATQ14207 1427 aa10.24□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 APBB1O00213 710 aa10.24□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 ADAM23O75077 832 aa10.24□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 ARHGEF15O94989 841 aa10.24□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 CLN3Q13286 438 aa10.24□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 GAS6Q14393 721 aa10.24□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 CYP2U1Q7Z449 544 aa10.24□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 GMCL1Q96IK5 515 aa10.24□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 OSBPL3Q9H4L5 887 aa10.24□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 MYO3AQ8NEV4 1616 aa10.24□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 CPS1P31327 1500 aa10.23□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 WHAMMQ8TF30 809 aa10.23□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 GRIP2Q9C0E4 1043 aa10.23□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10.23□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.23□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 RHOQP17081 205 aa10.22□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 TRIM22Q8IYM9 498 aa10.22□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa10.22□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 ZMYM3Q14202 1370 aa10.22□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.22□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 MEN1O00255 615 aa10.21□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 SVOPQ8N4V2 548 aa10.21□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 DYRK1BQ9Y463 629 aa10.21□□□□□ -0.77
CCL20-202ENST00000409189 CNTLNQ9NXG0 1405 aa10.21□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa10.2□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 MROH2AA6NES4 1674 aa10.2□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa10.2□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 ADAMTS2O95450 1211 aa10.2□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 PTPRKQ15262 1439 aa10.2□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 WDR44Q5JSH3 913 aa10.2□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 VWDEQ8N2E2 1590 aa10.2□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 CLIP1P30622 1438 aa10.19□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa10.19□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 MYO5CQ9NQX4 1742 aa10.19□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 MLH3Q9UHC1 1453 aa10.18□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 NLRP3Q96P20 1036 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms