RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WWC1Q8IX03 1113 aa19.95■□□□□ 0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPON1Q9HCB6 807 aa19.95■□□□□ 0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C4BP0C0L5 1744 aa19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAPPC3LQ5T215 181 aa19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHF14O94880 888 aa19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF853P0CG23 659 aa19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL16Q14005 1332 aa19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMIGO3Q86WK7 504 aa19.92■□□□□ 0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR63Q8IWG1 891 aa19.92■□□□□ 0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa19.91■□□□□ 0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOXB7P09629 217 aa19.9■□□□□ 0.78
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP16Q9Y5T5 823 aa19.9■□□□□ 0.78
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBR2Q8IWV8 1755 aa19.89■□□□□ 0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MBIPQ9NS73 344 aa19.89■□□□□ 0.77
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERBB4Q15303 1308 aa19.88■□□□□ 0.77
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TJP1Q07157 1748 aa19.87■□□□□ 0.77
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CASZ1Q86V15 1759 aa19.86■□□□□ 0.77
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHMP4AQ9BY43 222 aa19.86■□□□□ 0.77
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZPR1O75312 459 aa19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NARFQ9UHQ1 456 aa19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 QSER1Q2KHR3 1735 aa19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF521Q96K83 1311 aa19.83■□□□□ 0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGL2O15211 777 aa19.83■□□□□ 0.77
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRP5O75197 1615 aa19.82■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KDM3BQ7LBC6 1761 aa19.82■□□□□ 0.76
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.81■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBPF26B4DH59 902 aa19.81■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.81■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBPF15Q8N660 670 aa19.81■□□□□ 0.76
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARXQ96QS3 562 aa19.8■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLGA2Q08379 1002 aa19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRT24Q2M2I5 525 aa19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USPL1Q5W0Q7 1092 aa19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP19.77■□□□□ 0.76
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBR3Q6ZT12 1888 aa19.77■□□□□ 0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 E9PSI1 815 aa19.76■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAMTA2O94983 1202 aa19.76■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MMP10P09238 476 aa19.76■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FKBP8Q14318 412 aa19.76■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDIA6Q15084 440 aa19.76■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLEC4GQ6UXB4 293 aa19.76■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C8orf58Q8NAV2 365 aa19.76■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa19.76■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF652Q9Y2D9 606 aa19.76■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERVV-1B6SEH8 477 aa19.75■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRP10Q7Z4F1 713 aa19.75■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYL6BP14649 208 aa19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TM4SF1P30408 202 aa19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC30Q5VVM6 783 aa19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF6Q6ZMV9 814 aa19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCL2L12Q9HB09 334 aa19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HYPKQ9NX55 129 aa19.73■□□□□ 0.75
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