RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393038.2

PTRH2-201, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTRH2, Length 901 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRH2-201ENST00000393038 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
PTRH2-201ENST00000393038 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
PTRH2-201ENST00000393038 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
PTRH2-201ENST00000393038 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
PTRH2-201ENST00000393038 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.67■□□□□ 0.1
PTRH2-201ENST00000393038 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.67■□□□□ 0.1
PTRH2-201ENST00000393038 COL24A1Q17RW2 1714 aa15.66■□□□□ 0.1
PTRH2-201ENST00000393038 APAF1O14727 1248 aa15.66■□□□□ 0.1
PTRH2-201ENST00000393038 PHF14O94880 888 aa15.66■□□□□ 0.1
PTRH2-201ENST00000393038 STARD3NLO95772 234 aa15.66■□□□□ 0.1
PTRH2-201ENST00000393038 NEUROD2Q15784 382 aa15.66■□□□□ 0.1
PTRH2-201ENST00000393038 TRAPPC3LQ5T215 181 aa15.66■□□□□ 0.1
PTRH2-201ENST00000393038 CCDC87Q9NVE4 849 aa15.66■□□□□ 0.1
PTRH2-201ENST00000393038 MIS18AQ9NYP9 233 aa15.65■□□□□ 0.1
PTRH2-201ENST00000393038 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 SMIM5Q71RC9 77 aa15.64■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 KDM3BQ7LBC6 1761 aa15.63■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 POLD1P28340 1107 aa15.63■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa15.62■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 CHL1O00533 1208 aa15.61■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 RFC4P35249 363 aa15.61■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 ARXQ96QS3 562 aa15.61■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.61■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 USP16Q9Y5T5 823 aa15.61■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 EIF5P55010 431 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 CCDC27Q2M243 656 aa15.6■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 MSL1Q68DK7 614 aa15.6■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa15.59■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 CCER2I3L3R5 266 aa15.59■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 NLGN1Q8N2Q7 840 aa15.59■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 CFAP44Q96MT7 982 aa15.59■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 COL15A1P39059 1388 aa15.59■□□□□ 0.09
PTRH2-201ENST00000393038 A0A087WZG4 1122 aa15.58■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 A1BGP04217 495 aa15.58■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 GYS1P13807 737 aa15.58■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 NARFQ9UHQ1 456 aa15.58■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 C4AP0C0L4 1744 aa15.57■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 ZNF853P0CG23 659 aa15.57■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.57■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 ZPR1O75312 459 aa15.56■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 IFT57Q9NWB7 429 aa15.56■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 GNAI1P63096 354 aa15.55■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 NGEFQ8N5V2 710 aa15.55■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 SYT17Q9BSW7 474 aa15.55■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.54■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 NBPF26B4DH59 902 aa15.54■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 MMP10P09238 476 aa15.54■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 USPL1Q5W0Q7 1092 aa15.54■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 WWC1Q8IX03 1113 aa15.54■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 NBPF15Q8N660 670 aa15.54■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 ERBB4Q15303 1308 aa15.53■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 FKBP8Q14318 412 aa15.53■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 MBIPQ9NS73 344 aa15.53■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 HOXB7P09629 217 aa15.52■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 TM4SF1P30408 202 aa15.52■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 BCL2L12Q9HB09 334 aa15.52■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 CD2APQ9Y5K6 639 aa15.52■□□□□ 0.08
PTRH2-201ENST00000393038 IL16Q14005 1332 aa15.51■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 RGL2O15211 777 aa15.51■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.51■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 CAMTA2O94983 1202 aa15.5■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 WDR63Q8IWG1 891 aa15.5■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 PARP3Q9Y6F1 533 aa15.5■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 KRT24Q2M2I5 525 aa15.49■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.49■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.48■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 DDR1Q08345 913 aa15.48■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 NFIXQ14938 502 aa15.48■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 PDIA6Q15084 440 aa15.48■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.48■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 KLHL34Q8N239 644 aa15.48■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 SCN7AQ01118 1682 aa15.48■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.47■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 MIER1Q8N108 512 aa15.47■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.46■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.46■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.46■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTRH2-201ENST00000393038 C10orf71Q711Q0 1435 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms