RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 LINC00116Q8NCU8 138 aa36.3■■■■□ 3.4
GIPC1-202ENST00000393028 C4BP0C0L5 1744 aa36.29■■■■□ 3.4
GIPC1-202ENST00000393028 BCL2L13Q9BXK5 485 aa36.29■■■■□ 3.4
GIPC1-202ENST00000393028 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
GIPC1-202ENST00000393028 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
GIPC1-202ENST00000393028 BAG6P46379 1132 aa36.28■■■■□ 3.4
GIPC1-202ENST00000393028 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
GIPC1-202ENST00000393028 RARSP54136 660 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
GIPC1-202ENST00000393028 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
GIPC1-202ENST00000393028 SLC27A3Q5K4L6 730 aa36.26■■■■□ 3.4
GIPC1-202ENST00000393028 SSH1Q8WYL5 1049 aa36.26■■■■□ 3.4
GIPC1-202ENST00000393028 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP36.26■■■■□ 3.41e-8■■■■■ 38.3
GIPC1-202ENST00000393028 NUP188Q5SRE5 1749 aa36.26■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 STARD3NLO95772 234 aa36.25■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC30Q5VVM6 783 aa36.25■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 CAMKK2Q96RR4 588 aa36.25■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 CHPF2Q9P2E5 772 aa36.25■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 RCAN3Q9UKA8 241 aa36.25■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 ANXA1P04083 346 aa36.24■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 A1BGP04217 495 aa36.24■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC125Q86Z20 511 aa36.24■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 CRKLP46109 303 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 PROSER3Q2NL68 480 aa36.23■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF428Q96B54 188 aa36.23■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 SMC4Q9NTJ3 1288 aa36.23■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 STK31Q9BXU1 1019 aa36.21■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 NBPF26B4DH59 902 aa36.2■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 BCAR3O75815 825 aa36.2■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 NBPF14Q5TI25 921 aa36.2■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 NBPF15Q8N660 670 aa36.2■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa36.2■■■■□ 3.39
GIPC1-202ENST00000393028 PDIA6Q15084 440 aa36.19■■■■□ 3.38
GIPC1-202ENST00000393028 ALDH1L2Q3SY69 923 aa36.19■■■■□ 3.38
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC87Q9NVE4 849 aa36.19■■■■□ 3.38
GIPC1-202ENST00000393028 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa36.19■■■■□ 3.38
GIPC1-202ENST00000393028 UBR3Q6ZT12 1888 aa36.18■■■■□ 3.38
GIPC1-202ENST00000393028 MYL6BP14649 208 aa36.18■■■■□ 3.38
GIPC1-202ENST00000393028 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
GIPC1-202ENST00000393028 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
GIPC1-202ENST00000393028 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
GIPC1-202ENST00000393028 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa36.17■■■■□ 3.38
GIPC1-202ENST00000393028 SLC4A2P04920 1241 aa36.17■■■■□ 3.38
GIPC1-202ENST00000393028 CANXP27824 592 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
GIPC1-202ENST00000393028 CHMP4AQ9BY43 222 aa36.17■■■■□ 3.38
GIPC1-202ENST00000393028 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.38
GIPC1-202ENST00000393028 ERBB4Q15303 1308 aa36.17■■■■□ 3.38
GIPC1-202ENST00000393028 G2E3Q7L622 706 aa36.13■■■■□ 3.37
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
GIPC1-202ENST00000393028 LRP10Q7Z4F1 713 aa36.11■■■■□ 3.37
GIPC1-202ENST00000393028 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
GIPC1-202ENST00000393028 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
GIPC1-202ENST00000393028 AK7Q96M32 723 aa36.11■■■■□ 3.37
GIPC1-202ENST00000393028 GNPATO15228 680 aa36.1■■■■□ 3.37
GIPC1-202ENST00000393028 HYPKQ9NX55 129 aa36.1■■■■□ 3.37
GIPC1-202ENST00000393028 C4AP0C0L4 1744 aa36.09■■■■□ 3.37
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF827Q17R98 1081 aa36.09■■■■□ 3.37
GIPC1-202ENST00000393028 SMIM5Q71RC9 77 aa36.09■■■■□ 3.37
GIPC1-202ENST00000393028 AMIGO3Q86WK7 504 aa36.07■■■■□ 3.37
GIPC1-202ENST00000393028 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 FLIIQ13045 1269 aa36.06■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 XAGE3Q8WTP9 111 aa36.06■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 COL15A1P39059 1388 aa36.05■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa36.05■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 KIF16BQ96L93 1317 aa36.05■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 EIF5P55010 431 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 AKT1S1Q96B36 256 aa36.04■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 RPS6KA4O75676 772 aa36.03■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 COPS6Q7L5N1 327 aa36.03■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 BCORQ6W2J9 1755 aa36.03■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 PHF14O94880 888 aa36.02■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 TTLL7Q6ZT98 887 aa36.02■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 PLIN1O60240 522 aa36.01■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
GIPC1-202ENST00000393028 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 QSER1Q2KHR3 1735 aa36■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 ARXQ96QS3 562 aa35.99■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 TNNQ9UQP3 1299 aa35.99■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 SCN7AQ01118 1682 aa35.99■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 RRP1P56182 461 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 NUP98P52948 1817 aa35.97■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa35.97■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 PTPRCP08575 1304 aa35.97■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 STK32BQ9NY57 414 aa35.96■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa35.96■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 ADCY9O60503 1353 aa35.96■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa35.95■■■■□ 3.35
GIPC1-202ENST00000393028 KIF6Q6ZMV9 814 aa35.94■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 ZBTB3Q9H5J0 574 aa35.94■■■■□ 3.34
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