RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.49■■□□□ 1.67
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KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM94Q12767 1356 aa25.48■■□□□ 1.67
KCNQ1-202ENST00000335475 TRAK2O60296 914 aa25.48■■□□□ 1.67
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB11FIP3O75154 756 aa25.47■■□□□ 1.67
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KCNQ1-202ENST00000335475 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa25.47■■□□□ 1.67
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KCNQ1-202ENST00000335475 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.43■■□□□ 1.66
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KCNQ1-202ENST00000335475 SSFA2P28290 1259 aa25.42■■□□□ 1.66
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KCNQ1-202ENST00000335475 ST18O60284 1047 aa25.41■■□□□ 1.66
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KCNQ1-202ENST00000335475 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.41■■□□□ 1.66
KCNQ1-202ENST00000335475 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.41■■□□□ 1.66
KCNQ1-202ENST00000335475 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.4■■□□□ 1.66
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KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.39■■□□□ 1.66
KCNQ1-202ENST00000335475 RILPL2Q969X0 211 aa25.39■■□□□ 1.66
KCNQ1-202ENST00000335475 IL17RAQ96F46 866 aa25.39■■□□□ 1.65
KCNQ1-202ENST00000335475 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.38■■□□□ 1.65
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KCNQ1-202ENST00000335475 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
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KCNQ1-202ENST00000335475 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.37■■□□□ 1.65
KCNQ1-202ENST00000335475 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
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KCNQ1-202ENST00000335475 GLI3P10071 1580 aa25.35■■□□□ 1.65
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KCNQ1-202ENST00000335475 ANAPC15P60006 121 aa25.34■■□□□ 1.65
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KCNQ1-202ENST00000335475 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
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KCNQ1-202ENST00000335475 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.3■■□□□ 1.64
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KCNQ1-202ENST00000335475 GRM8O00222 908 aa25.29■■□□□ 1.64
KCNQ1-202ENST00000335475 NEK4P51957 841 aa25.29■■□□□ 1.64
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KCNQ1-202ENST00000335475 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
KCNQ1-202ENST00000335475 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
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KCNQ1-202ENST00000335475 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.28■■□□□ 1.64
KCNQ1-202ENST00000335475 CHRNA2Q15822 529 aa25.28■■□□□ 1.64
KCNQ1-202ENST00000335475 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.28■■□□□ 1.64
KCNQ1-202ENST00000335475 CYP27B1O15528 508 aa25.27■■□□□ 1.64
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KCNQ1-202ENST00000335475 IGKV5-2P06315 115 aa25.27■■□□□ 1.64
KCNQ1-202ENST00000335475 TMX3Q96JJ7 454 aa25.27■■□□□ 1.64
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