RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316436.3

LSMEM2-201, Transcript of leucine rich single-pass membrane protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LSMEM2, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSMEM2-201ENST00000316436 PROSER3Q2NL68 480 aa20.39■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 PDIA6Q15084 440 aa20.38■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.38■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 PLIN1O60240 522 aa20.37■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.37■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 ANXA1P04083 346 aa20.37■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 G2E3Q7L622 706 aa20.37■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.37■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 TNNQ9UQP3 1299 aa20.37■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 C4BP0C0L5 1744 aa20.35■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 NBPF26B4DH59 902 aa20.35■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 KCNQ4P56696 695 aa20.35■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 NBPF14Q5TI25 921 aa20.35■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 NBPF15Q8N660 670 aa20.35■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 KIF16BQ96L93 1317 aa20.35■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.34■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC4A2P04920 1241 aa20.34■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 ATP6V1AP38606 617 aa20.33■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.33■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 STK31Q9BXU1 1019 aa20.33■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 A1BGP04217 495 aa20.32■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.32■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 ERBB4Q15303 1308 aa20.32■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.32■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 TRIM27P14373 513 aa20.3■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 FLIIQ13045 1269 aa20.3■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.3■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.3■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 RLBP1P12271 317 aa20.29■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 MYL6BP14649 208 aa20.29■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 PROM2Q8N271 834 aa20.29■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.29■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.28■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 ADCY9O60503 1353 aa20.28■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 STARD3NLO95772 234 aa20.28■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 APBA3O96018 575 aa20.28■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.28■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.28■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.28■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 BCORQ6W2J9 1755 aa20.27■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 C4AP0C0L4 1744 aa20.27■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 ABCC4O15439 1325 aa20.27■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 PTPRCP08575 1304 aa20.27■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.27■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.27■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.27■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 HYPKQ9NX55 129 aa20.27■□□□□ 0.84
LSMEM2-201ENST00000316436 PLSCR1O15162 318 aa20.26■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 PANK1Q8TE04 598 aa20.26■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 SCN7AQ01118 1682 aa20.26■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.26■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 TXNRD1Q16881 649 aa20.25■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.25■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.25■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 F6X3S4 739 aa20.24■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.24■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.24■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.23■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 PDE3AQ14432 1141 aa20.23■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.23■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 COPS6Q7L5N1 327 aa20.23■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.21■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 COL15A1P39059 1388 aa20.21■□□□□ 0.83
LSMEM2-201ENST00000316436 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 SMIM5Q71RC9 77 aa20.2■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.2■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 CRBNQ96SW2 442 aa20.2■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 NUP98P52948 1817 aa20.19■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 ATP10DQ9P241 1426 aa20.19■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.19■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.19■□□□□ 0.82
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