RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 ST18O60284 1047 aa23.57■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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USP21-201ENST00000289865 ERBB3P21860 1342 aa23.56■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 AOX1Q06278 1338 aa23.56■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 AK9Q5TCS8 1911 aa23.56■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 SSFA2P28290 1259 aa23.55■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 CHMLP26374 656 aa23.55■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 PROSER3Q2NL68 480 aa23.55■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.55■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 MST1RQ04912 1400 aa23.54■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.54■■□□□ 1.36
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USP21-201ENST00000289865 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
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USP21-201ENST00000289865 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.54■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.53■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 ARXQ96QS3 562 aa23.52■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.52■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 ATF3P18847 181 aa23.52■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.52■■□□□ 1.36
USP21-201ENST00000289865 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.51■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.5■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 FSD2A1L4K1 749 aa23.5■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 KSR2Q6VAB6 950 aa23.5■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.5■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.5■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.5■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 TMEM94Q12767 1356 aa23.49■■□□□ 1.35
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USP21-201ENST00000289865 ALDH1L1O75891 902 aa23.48■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 PTMSP20962 102 aa23.48■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.48■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 HYPKQ9NX55 129 aa23.48■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.47■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.47■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 NEK4P51957 841 aa23.47■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.47■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 PALD1Q9ULE6 856 aa23.47■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.46■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 NUCB2P80303 420 aa23.46■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 SLC39A6Q13433 755 aa23.45■■□□□ 1.35
USP21-201ENST00000289865 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 MTX1Q13505 466 aa23.45■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.44■■□□□ 1.34
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USP21-201ENST00000289865 COL18A1P39060 1754 aa23.44■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 MEGF6O75095 1541 aa23.44■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.44■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 ZNF790Q6PG37 636 aa23.44■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.44■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 IL25Q9H293 177 aa23.44■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.44■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.43■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 C5P01031 1676 aa23.43■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.43■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 PHKG2P15735 406 aa23.43■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 ANAPC15P60006 121 aa23.43■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 DCCP43146 1447 aa23.43■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 PKP1Q13835 747 aa23.42■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 SPG7Q9UQ90 795 aa23.42■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 PDIA6Q15084 440 aa23.42■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 CNTROBQ8N137 903 aa23.41■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 LINS1Q8NG48 757 aa23.41■■□□□ 1.34
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USP21-201ENST00000289865 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.41■■□□□ 1.34
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USP21-201ENST00000289865 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.4■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 TMX3Q96JJ7 454 aa23.4■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 GRM8O00222 908 aa23.4■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 MCM2P49736 904 aa23.4■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.39■■□□□ 1.34
USP21-201ENST00000289865 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 SUCLG2Q96I99 432 aa23.39■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.38■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.38■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 MYL6BP14649 208 aa23.38■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 MCTP1Q6DN14 999 aa23.38■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.38■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 IL17RAQ96F46 866 aa23.38■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.331e-6■■■□□ 16.8
USP21-201ENST00000289865 SGSM2O43147 1006 aa23.37■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 MRE11P49959 708 aa23.37■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.37■■□□□ 1.33
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