RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.53■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.53■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.53■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 EVI5LQ96CN4 794 aa25.52■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 MCM5P33992 734 aa25.52■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 CFAP100Q494V2 611 aa25.52■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.52■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 PTPN14Q15678 1187 aa25.52■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 USP48Q86UV5 1035 aa25.52■■□□□ 1.68
USP12-201ENST00000282344 ACBD3Q9H3P7 528 aa25.51■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 ADAMTS12P58397 1594 aa25.51■■□□□ 1.67
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USP12-201ENST00000282344 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.51■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.51■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 DISP1Q96F81 1524 aa25.5■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 CCDC66A2RUB6 948 aa25.5■■□□□ 1.67
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USP12-201ENST00000282344 CCDC69A6NI79 296 aa25.5■■□□□ 1.67
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USP12-201ENST00000282344 CAGE1Q8TC20 777 aa25.5■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
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USP12-201ENST00000282344 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.49■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 USP26Q9BXU7 913 aa25.49■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 ANO10Q9NW15 660 aa25.49■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.49■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 RUFY1Q96T51 708 aa25.49■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.49■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 PIK3R4Q99570 1358 aa25.48■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 TNNT1P13805 278 aa25.48■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 ATP8B2P98198 1209 aa25.48■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 SMARCE1Q969G3 411 aa25.48■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 A0A087WZG4 1122 aa25.48■■□□□ 1.67
USP12-201ENST00000282344 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.47■■□□□ 1.67
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USP12-201ENST00000282344 CDKL5O76039 1030 aa25.47■■□□□ 1.67
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USP12-201ENST00000282344 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.47■■□□□ 1.67
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USP12-201ENST00000282344 TXLNAP40222 546 aa25.45■■□□□ 1.66
USP12-201ENST00000282344 TDO2P48775 406 aa25.45■■□□□ 1.66
USP12-201ENST00000282344 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
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USP12-201ENST00000282344 KDM6BO15054 1643 aa25.44■■□□□ 1.66
USP12-201ENST00000282344 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.44■■□□□ 1.66
USP12-201ENST00000282344 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.44■■□□□ 1.66
USP12-201ENST00000282344 BIN1O00499 593 aa25.44■■□□□ 1.66
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USP12-201ENST00000282344 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.44■■□□□ 1.66
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USP12-201ENST00000282344 KIF18AQ8NI77 898 aa25.43■■□□□ 1.66
USP12-201ENST00000282344 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.43■■□□□ 1.66
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USP12-201ENST00000282344 DACH1Q9UI36 760 aa25.42■■□□□ 1.66
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USP12-201ENST00000282344 G2E3Q7L622 706 aa25.4■■□□□ 1.66
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USP12-201ENST00000282344 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
USP12-201ENST00000282344 DYNC1I1O14576 645 aa25.4■■□□□ 1.66
USP12-201ENST00000282344 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
USP12-201ENST00000282344 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.4■■□□□ 1.66
USP12-201ENST00000282344 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
USP12-201ENST00000282344 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
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