RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265175.5

SEC24B-201, Transcript of SEC24 homolog B, COPII coat complex component, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC24B, Length 5,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24B-201ENST00000265175 KIF20AO95235 890 aa14.74□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.74□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 ISM2Q6H9L7 571 aa14.73□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 WASF1Q92558 559 aa14.73□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 USP48Q86UV5 1035 aa14.73□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 AFAP1Q8N556 730 aa14.73□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 SNX21Q969T3 373 aa14.73□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.73□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 YEATS4O95619 227 aa14.72□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 F6X3S4 739 aa14.72□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.72□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.72□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.72□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.051e-6■■■□□ 15
SEC24B-201ENST00000265175 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.72□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.72□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.72□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 OGFRQ9NZT2 677 aa14.72□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.72□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 DACT1Q9NYF0 836 aa14.71□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 SOGA3Q5TF21 947 aa14.71□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 ABTB2Q8N961 1025 aa14.71□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.71□□□□□ -0.05
SEC24B-201ENST00000265175 ATP2C2O75185 946 aa14.71□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 TDO2P48775 406 aa14.71□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.71□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.71□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.71□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 NCOA1Q15788 1441 aa14.7□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 TTC22Q5TAA0 569 aa14.7□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 SMC5Q8IY18 1101 aa14.7□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.7□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 NAIPQ13075 1403 aa14.7□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.7□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.7□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 SEC24BO95487 1268 aa14.7□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 MYL6BP14649 208 aa14.7□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 NF2P35240 595 aa14.7□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.7□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 PTGS1P23219 599 aa14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 CDK19Q9BWU1 502 aa14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 IDH1O75874 414 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 ABCC11Q96J66 1382 aa14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 NSD3Q9BZ95 1437 aa14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 PPFIA3O75145 1194 aa14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 PHACTR2O75167 634 aa14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 UBASH3AP57075 661 aa14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 ZBTB9Q96C00 473 aa14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.69□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 MCM10Q7L590 875 aa14.68□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 JADE2Q9NQC1 790 aa14.68□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 SDSP20132 328 aa14.68□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.68□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.68□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 EBAG9O00559 213 aa14.68□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 CTAGE8P0CG41 777 aa14.68□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.062e-7■■■■□ 20.2
SEC24B-201ENST00000265175 HSPA4P34932 840 aa14.68□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 NUCB1Q02818 461 aa14.68□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.68□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.68□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 GOPCQ9HD26 462 aa14.68□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 NECAB1Q8N987 351 aa14.67□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.67□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 GTF3C6Q969F1 213 aa14.67□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 ATP2B2Q01814 1243 aa14.67□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 CCDC102BQ68D86 513 aa14.67□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.66□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 CEP57Q86XR8 500 aa14.66□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 TYRO3Q06418 890 aa14.66□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 RBSNQ9H1K0 784 aa14.66□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 N4BP3O15049 544 aa14.65□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 UBE4AQ14139 1066 aa14.65□□□□□ -0.06
SEC24B-201ENST00000265175 VPS36Q86VN1 386 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms