RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
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PTPRB-201ENST00000261266 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
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PTPRB-201ENST00000261266 SNX21Q969T3 373 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRB-201ENST00000261266 SIL1Q9H173 461 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRB-201ENST00000261266 NUCB1Q02818 461 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRB-201ENST00000261266 CATIPQ7Z7H3 387 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRB-201ENST00000261266 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRB-201ENST00000261266 GOLIM4O00461 696 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF213O14771 459 aa10.5□□□□□ -0.73
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