RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Aifm3Q3TY86 605 aa28.88■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atg3Q9CPX6 314 aa28.88■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cap2Q9CYT6 476 aa28.88■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pnmal2G3X9N3 661 aa28.87■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Shank3Q4ACU6 1730 aa28.87■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tm6sf1P58749 370 aa28.86■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trim27Q62158 513 aa28.86■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BcorQ8CGN4 1759 aa28.86■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cgnl1Q6AW69 1298 aa28.85■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prkab2Q6PAM0 271 aa28.85■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 SympkQ80X82 1284 aa28.85■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CoilQ5SU73 570 aa28.85■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mre11Q61216 706 aa28.84■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fbln2P37889 1221 aa28.82■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Aldh8a1Q8BH00 487 aa28.82■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Flad1Q8R123 492 aa28.82■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dcaf5Q80T85 946 aa28.81■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cyp2d11P24457 504 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rabep1O35551 862 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Jmjd4Q8BFT6 427 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lrit1Q8K099 624 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppfibp2O35711 882 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Disp3A3KFU9 1347 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Morc2aQ69ZX6 1030 aa28.76■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cog6Q8R3I3 657 aa28.76■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Klc3Q91W40 508 aa28.76■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gcc1Q9D4H2 778 aa28.76■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc39a6Q8C145 765 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Adcy9P51830 1353 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Wdr63B2RY71 923 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mylk2Q8VCR8 613 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mcm2P97310 904 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Echdc1Q9D9V3 322 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igfbp6P47880 238 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fgd1P52734 960 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sptbn5F6UCX4 1208 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam13aQ8BGI4 693 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Abca3Q8R420 1704 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prkar2bP31324 416 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Triml2E9PW10 424 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ly75Q60767 1723 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Col4a1P02463 1669 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Syde2E9PUP1 1314 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Clcn1Q64347 994 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ubap1lG3UW59 384 aa28.7■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nav1Q8CH77 1875 aa28.7■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Flt4P35917 1363 aa28.7■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cers3Q1A3B0 383 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm12185Q5NCB2 835 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sugp2Q8CH09 1067 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sos2Q02384 1333 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Irf9Q61179 399 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ttll7A4Q9F0 912 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pde4dQ01063 747 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Arhgap33Q80YF9 1305 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Erbb4Q61527 1308 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trim52Q8CDV4 233 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kndc1Q0KK55 1742 aa28.64■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 GalcP54818 684 aa28.64■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa28.64■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Stk36Q69ZM6 1316 aa28.64■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Map3k2Q61083 619 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Exoc6bA6H5Z3 810 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 FanclQ9CR14 375 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bicdl1A0JNT9 577 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hoxa7P02830 229 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ankle2Q6P1H6 964 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MetP16056 1379 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Miga2Q8BK03 593 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kif2cQ922S8 721 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CenppQ9CZ92 286 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ric1Q69ZJ7 1422 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bend3Q6PAL0 825 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hspa2P17156 633 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa28.57■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zbtb1Q91VL9 713 aa28.57■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppm1mQ8BU27 406 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10093D3YYI8 482 aa28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.2 ms