RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC34A2O95436 690 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 C21orf58P58505 322 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP4F3Q08477 520 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 TLR1Q15399 786 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 ADPRMQ3LIE5 342 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 C16orf89Q6UX73 402 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 HACD2Q6Y1H2 254 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 GATAD2AQ86YP4 633 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 DEFB107AQ8IZN7 70 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 MCUR1Q96AQ8 359 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 DUSP23Q9BVJ7 150 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 AICDAQ9GZX7 198 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 MCM8Q9UJA3 840 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDH15Q96QU1 1955 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 CTSVO60911 334 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL18O94889 574 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPIND1P05546 499 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 PVRP15151 417 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 GLB1P16278 677 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 PRPS1L1P21108 318 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 PGM1P36871 562 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 ASMTP46597 345 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 LPAL2Q16609 132 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 TIGD2Q4W5G0 525 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM35AQ53FP2 167 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM61Q5EBN2 209 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 VN1R4Q7Z5H5 301 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 PGAM4Q8N0Y7 254 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.48e-53■■■□□ 14.8
CAPNS1-215ENST00000628018 TESCQ96BS2 214 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 THAP11Q96EK4 314 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 FCRL4Q96PJ5 515 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2A5Q96R48 311 aa23.77■■□□□ 1.4
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CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL25Q9H0H3 589 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 SEMA6CQ9H3T2 930 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM86C2PA6NEL3 165 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 CFLARO15519 480 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 IL6P05231 212 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 BSGP35613 385 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 RAP1GDS1P52306 607 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 DGKQP52824 942 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE3DQ7Z6J8 389 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 RGMAQ96B86 450 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ROPN1LQ96C74 230 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 TM4SF19Q96DZ7 209 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 CENPKQ9BS16 269 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 THTPAQ9BU02 230 aa23.76■■□□□ 1.39
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CAPNS1-215ENST00000628018 C11orf16Q9NQ32 467 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 LHX9Q9NQ69 397 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMA1P25391 3075 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP33O14559 1287 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 LRATO95237 230 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 KLK1P06870 262 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ALPPL2P10696 532 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF763Q0D2J5 394 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 NR1D2Q14995 579 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 PAGE3Q5JUK9 113 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 SPANXN4Q5MJ08 99 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP24Q8N264 748 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4C6Q8NH72 309 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC13A3Q8WWT9 602 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 MS4A6EQ96DS6 147 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 LOXL4Q96JB6 756 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC6A16Q9GZN6 736 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A088AWK7 358 aa23.74■■□□□ 1.39
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CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM38O00635 465 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF10O60809 474 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 GBAP04062 536 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 PGRP06401 933 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR3P46089 330 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 CCT8P50990 548 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ARFIP1P53367 373 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 IRGCQ6NXR0 463 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF44Q7L0R7 432 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 PAGE2Q7Z2X7 111 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ASPGQ86U10 573 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 NT5CQ8TCD5 201 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-215ENST00000628018 MACROD1Q9BQ69 325 aa23.74■■□□□ 1.39
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