RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553628.1

AC009396.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009396.1, Length 1,079 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009396.1-201ENST00000553628 FGF5P12034 268 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 PORP16435 677 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ALOX12P18054 663 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ANOS1P23352 680 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 GCH1P30793 250 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ACSL1P33121 698 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CCR2P41597 374 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 RPS9P46781 194 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 NOVP48745 357 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 PNLIPRP2P54317 469 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 LY6DQ14210 128 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 PON2Q15165 354 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 GALNT5Q7Z7M9 940 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 PTOV1Q86YD1 416 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 DEFB119Q8N690 84 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 METTL13Q8N6R0 699 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 RDM1Q8NG50 284 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM3CQ92520 227 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF354BQ96LW1 612 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 TAS2R14Q9NYV8 317 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 AMACRQ9UHK6 382 aa4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CACNA1DQ01668 2161 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 C15orf62A8K5M9 175 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 FIBPO43427 364 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 C22orf31O95567 290 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CAVIN2O95810 425 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CCNE2O96020 404 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 GDI1P31150 447 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CHAF1BQ13112 559 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CUL4AQ13619 759 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 SPATA1Q5VX52 437 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ALS2CLQ60I27 953 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 PLA2G4FQ68DD2 849 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 VITQ6UXI7 678 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 NR4A3Q92570 626 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 SEMA4DQ92854 862 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 PAFAH2Q99487 392 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CLMPQ9H6B4 373 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM9BQ9NQ34 198 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM118AQ9NWS6 357 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 MIOSQ9NXC5 875 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ERAP1Q9NZ08 941 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 HES2Q9Y543 173 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 MYOFQ9NZM1 2061 aa4.85□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 FBN2P35556 2912 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 NOTCH2Q04721 2471 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 FRMPD4Q14CM0 1322 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 A0A0D9SFI3 127 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CYTH3O43739 400 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CREG1O75629 220 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 POLR2MP0CAP2 368 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CFC1BP0CG36 223 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CFC1P0CG37 223 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 MSH3P20585 1137 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CBLP22681 906 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 OR1G1P47890 313 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 GLIPR1P48060 266 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CCR3P51677 355 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 SNX16P57768 344 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 EPS8Q12929 822 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 PRKAA1Q13131 559 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 DUOXA1Q1HG43 343 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 RILPL1Q5EBL4 403 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 TECRLQ5HYJ1 363 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 WDR38Q5JTN6 314 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM78AQ5JUQ0 283 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 LINC00346Q8IVM7 164 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 POC5Q8NA72 575 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 SEPT1Q8WYJ6 367 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF524Q96C55 264 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 LRRC3BQ96PB8 259 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 APOL6Q9BWW8 343 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 RTN4RQ9BZR6 473 aa4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC38A7Q9NVC3 462 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms