RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 OR9A4Q8NGU2 314 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 VPS50Q96JG6 964 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 ACSS2Q9NR19 701 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 XPR1Q9UBH6 696 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 TBK1Q9UHD2 729 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 ASB1Q9Y576 335 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 SMIM24O75264 130 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 MMP11P24347 488 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 FOXL2P58012 376 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 CHIT1Q13231 466 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 ATP1A4Q13733 1029 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 DOC2AQ14183 400 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 TBCCQ15814 346 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 MED25Q71SY5 747 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 MRGPREQ86SM8 312 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 LCA5Q86VQ0 697 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 AMER3Q8N944 861 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 ACMSDQ8TDX5 336 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 MOCOSQ96EN8 888 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 WDR34Q96EX3 536 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 CRB3Q9BUF7 120 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 COPG2Q9UBF2 871 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-222ENST00000532751 ANKDD1BA6NHY2 528 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 MKRN2OSH3BPM6 223 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SHBGP04278 402 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SERPINA6P08185 405 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 ALOX12P18054 663 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PIK3CGP48736 1102 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 KLC1Q07866 573 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.927e-7■■■□□ 15.4
PTPRK-222ENST00000532751 RBBP7Q16576 425 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 VWA2Q5GFL6 755 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 EMBQ6PCB8 327 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PRSS58Q8IYP2 241 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 TEX9Q8N6V9 391 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 CCT6BQ92526 530 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 TGIF2Q9GZN2 237 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 ING2Q9H160 280 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SGK494L7N484 410 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 FFAR3O14843 346 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 GPR42O15529 346 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 KLHL18O94889 574 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 HSD17B3P37058 310 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 CASP2P42575 452 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SYT16Q17RD7 645 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PRSS41Q7RTY9 318 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 TDRPQ86YL5 185 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 CREB3L4Q8TEY5 395 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 UBE2E3Q969T4 207 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SEMA4CQ9C0C4 833 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SLC6A16Q9GZN6 736 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PRM3Q9NNZ6 103 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 P4HTMQ9NXG6 502 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 C3orf18Q9UK00 162 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 MED13Q9UHV7 2174 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 STX16O14662 325 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PRAMEF4O60810 478 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 CLEC3AO75596 197 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 EPORP19235 508 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SLCO1A2P46721 670 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 CHAF1BQ13112 559 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 GTF2H2Q13888 395 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 CPZQ66K79 652 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 OR51Q1Q8NH59 317 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PHF21BQ96EK2 531 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SLC25A18Q9H1K4 315 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 HCN3Q9P1Z3 774 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SMIM23A6NLE4 172 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 AGPSO00116 658 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 RDH16O75452 317 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 WFS1O76024 890 aa20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms