RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504		F8W8V4	182 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	AQP7	O14520	342 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	CST8	O60676	142 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	B4GALT2	O60909	372 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	RDH16	O75452	317 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	GPC4	O75487	556 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	ITGA10	O75578	1167 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	C1orf105	O95561	183 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	GABRA1	P14867	456 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	ADRA1A	P35348	466 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	NR2C2	P49116	596 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	RHAG	Q02094	409 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	PRPSAP1	Q14558	356 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC10A1	Q14973	349 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	NAA25	Q14CX7	972 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	LAPTM4A	Q15012	233 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	KRT222	Q8N1A0	295 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	VAT1	Q99536	393 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	GBA3	Q9H227	469 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	TAC3	Q9UHF0	121 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A087X0T9	212 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A1B0GVC2	190 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504		A8MVJ9	347 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF487	B1APH4	448 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504		H7C0S8	307 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	HAT1	O14929	419 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	KCNAB3	O43448	404 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	PHF2	O75151	1096 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	GOSR1	O95249	250 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	IGHG3	P01860	377 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM228B	P0C875	321 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	FPR1	P21462	350 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	PSMB4	P28070	264 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	SSR4	P51571	173 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	MPP1	Q00013	466 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	TNK1	Q13470	666 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	TFDP2	Q14188	446 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	POU6F1	Q14863	301 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	TMED2	Q15363	201 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	ACKR1	Q16570	336 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	PACS1	Q6VY07	963 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	P3H4	Q92791	437 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	CCDC138	Q96M89	665 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	TTC1	Q99614	292 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	HPF1	Q9NWY4	346 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
HDLBP-222	ENST00000449504	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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