RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433541.1

TREX1-201, Transcript of three prime repair exonuclease 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TREX1, Length 1,105 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1-201ENST00000433541 FAR2Q96K12 515 aa14.76□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.76□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 PCTPQ9UKL6 214 aa14.76□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 FFAR3O14843 346 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 NKX2-8O15522 239 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 GPR42O15529 346 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 DLX3O60479 287 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 MED26O95402 600 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 TSPAN8P19075 237 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 GSTM2P28161 218 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 OTX2P32243 289 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 HERVK_113P63132 956 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 NFKB2Q00653 900 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 CDC20Q12834 499 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 FAM53BQ14153 422 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 HERC3Q15034 1050 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 TBCCQ15814 346 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 CFAP157Q5JU67 520 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 FAM69BQ5VUD6 431 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 LIPJQ5W064 366 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 SYVN1Q86TM6 617 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 FKBP10Q96AY3 582 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 REPS1Q96D71 796 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 TM4SF19Q96DZ7 209 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 SARGQ9BW04 601 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 ACSS2Q9NR19 701 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 SENP1Q9P0U3 644 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 CTSFQ9UBX1 484 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 TCFL5Q9UL49 500 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 LHX6Q9UPM6 363 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.75□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 ZNF860A6NHJ4 632 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 SGK494L7N484 410 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 PLIN3O60664 434 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 SH3BGRLO75368 114 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 KLHL18O94889 574 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 CLDN9O95484 217 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 OTCP00480 354 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 PROCP04070 461 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 SERPINA6P08185 405 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 SBK3P0C264 359 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 CPA3P15088 417 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 EPORP19235 508 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 CD22P20273 847 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 GCGRP47871 477 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 CDH13P55290 713 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 RAB8AP61006 207 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 SLC18A2Q05940 514 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 DSG2Q14126 1118 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 DEFB134Q4QY38 66 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 MILR1Q7Z6M3 343 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 RAB43Q86YS6 212 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 RDH11Q8TC12 318 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 NT5CQ8TCD5 201 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 MIEF2Q96C03 454 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 WDR34Q96EX3 536 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 CDK15Q96Q40 435 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 TMEM237Q96Q45 408 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 NT5DC2Q9H857 520 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 EMCNQ9ULC0 261 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.74□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa14.73□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 A0A088AWK7 358 aa14.73□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 A0A0G2JN53 185 aa14.73□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 FOXS1O43638 330 aa14.73□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 UGDHO60701 494 aa14.73□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 PRAMEF4O60810 478 aa14.73□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 RDH16O75452 317 aa14.73□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 CLEC3AO75596 197 aa14.73□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 WFS1O76024 890 aa14.73□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.9 ms