RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 SMYD1Q8NB12 490 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 FAR1Q8WVX9 515 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 HSPBAP1Q96EW2 488 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 PLEKHA8Q96JA3 519 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 EFCAB11Q9BUY7 163 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 FZD4Q9ULV1 537 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 GMPPBQ9Y5P6 360 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 MGAT4DA6NG13 374 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 TMEM202A6NGA9 273 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 TTC34A8MYJ7 566 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 CBFA2T3O75081 653 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 SLC16A8O95907 504 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PXNP49023 591 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 CTSCP53634 463 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 GP2P55259 537 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 RBBP4Q09028 425 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ADAM15Q13444 863 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 RGNQ15493 299 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ZNF765Q7L2R6 523 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 RNF175Q8N4F7 328 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 SGCDQ92629 289 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 SH3KBP1Q96B97 665 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 AP2M1Q96CW1 435 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 MED8Q96G25 268 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ATAD3AQ9NVI7 634 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 CLEC1BQ9P126 229 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 YY2O15391 372 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 GABARAPO95166 117 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 CTSLP07711 333 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 HTR1BP28222 390 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 LTBRP36941 435 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 BMXP51813 675 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 LAS2Q8IYD9 372 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 C11orf65Q8NCR3 313 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 HUS1BQ8NHY5 278 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 NECTIN3Q9NQS3 549 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 BTBD3Q9Y2F9 522 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 SLC22A1O15245 554 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 SUV39H1O43463 412 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 MITFO75030 526 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 C1orf105O95561 183 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ELFN1P0C7U0 828 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 HKDC1Q2TB90 917 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PROX2Q3B8N5 592 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PAGE2BQ5JRK9 111 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 GPR153Q6NV75 609 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 DEFB123Q8N688 67 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 RORBQ92753 470 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 MTERF3Q96E29 417 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 COQ10AQ96MF6 247 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 DOHHQ9BU89 302 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 GABARAPL3Q9BY60 117 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 RIBC2Q9H4K1 309 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 KRT84Q9NSB2 600 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 A8MVJ9 347 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 MYO1GB0I1T2 1018 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PTGES3LE9PB15 166 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PAPLNO95428 1278 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 KCNJ10P78508 379 aa22.87■■□□□ 1.25
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PMS1-205ENST00000409985 COL19A1Q14993 1142 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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PMS1-205ENST00000409985 TMEM220Q6QAJ8 160 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 XKR5Q6UX68 686 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 CNIH3Q8TBE1 160 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 SGPP1Q9BX95 441 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 REEP4Q9H6H4 257 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ITM2CQ9NQX7 267 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 KRT87PA6NCN2 255 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 H3BM21 787 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ETHE1O95571 254 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 NTHL1P78549 312 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 NPTX1Q15818 432 aa22.86■■□□□ 1.25
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