RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 HAPLN3Q96S86 360 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 BRF2Q9HAW0 419 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ZIM2Q9NZV7 527 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 GSTT2P0CG29 244 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 DPYSL2Q16555 572 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 SYPL2Q5VXT5 272 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 PIM3Q86V86 326 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 FAM46DQ8NEK8 389 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 SHKBP1Q8TBC3 707 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 PNPLA2Q96AD5 504 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 METTL7AQ9H8H3 244 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 GKN1Q9NS71 199 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 TAS2R10Q9NYW0 307 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 RPL10P27635 214 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 UFM1P61960 85 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 CREB5Q02930 508 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 MVKQ03426 396 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 DECR1Q16698 335 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 LRRC66Q68CR7 880 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 HSPBAP1Q96EW2 488 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 HSH2DQ96JZ2 352 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ORAI3Q9BRQ5 295 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 LDAHQ9H6V9 325 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ENAMQ9NRM1 1142 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 AGPSO00116 658 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 TNFP01375 233 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 LRRTM4Q86VH4 590 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 NINJ1Q92982 152 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 PYURFQ96I23 114 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 OR51I1Q9H343 314 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 USP29Q9HBJ7 922 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 LTN1O94822 1766 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 TBX10O75333 385 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 CBLP22681 906 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 MBLAC2Q68D91 279 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 PACRGLQ8N7B6 248 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 SLIT3O75094 1523 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 M0R129 80 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 IRAK2O43187 625 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 GBAP04062 536 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 DCKP27707 260 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 IRF5Q13568 498 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 GRHL2Q6ISB3 625 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ZNF709Q8N972 641 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 MAFIPQ8WZ33 124 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 OR10A4Q9H209 315 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa15.58■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 TNFRSF10BO14763 440 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 ADAMTS3O15072 1205 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 SSX5O60225 188 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 PRKACGP22612 351 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 LCN1P31025 176 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 GSK3BP49841 420 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 RAB8AP61006 207 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 TUBB3Q13509 450 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 TIGD5Q53EQ6 642 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 OR8K3Q8NH51 312 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 TMEM80Q96HE8 168 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 OSBPL2Q9H1P3 480 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 RHCGQ9UBD6 479 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 FETUBQ9UGM5 382 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 LAMP5Q9UJQ1 280 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 TRAV6A0A075B6T7 132 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 A0A1W2PQY0 241 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 LOC730098B7Z3J9 87 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 IL33O95760 270 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 NR2C1P13056 603 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 SYN1P17600 705 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 RPA4Q13156 261 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 SNTA1Q13424 505 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 LRP8Q14114 963 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 MEP1AQ16819 746 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 GALNT12Q8IXK2 581 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 OR4F6Q8NGB9 312 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 S100PBPQ96BU1 408 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 SCLYQ96I15 445 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 PKP2Q99959 881 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 NALCNQ8IZF0 1738 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 EOMESO95936 686 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 GP1BBP13224 206 aa15.58■□□□□ 0.08
RXRA-201ENST00000356384 FAM182AQ5T1J6 154 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms