RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdh12Q5RJH3 794 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sqstm1Q64337 442 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BC080695Q66JY9 481 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SynbQ8BI41 618 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chst8Q8BQ86 417 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb9Q8CDC7 459 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem125Q8CHQ6 216 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnfaip8l1Q8K288 186 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gprc6aQ8K4Z6 928 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mterf3Q8R3J4 412 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam32aQ9CR80 112 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem269Q9D4Y8 254 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TrilQ9DBY4 809 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igf2rQ07113 2483 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc1a5P51912 553 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrlrQ08501 608 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Med26Q7TN02 588 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 QpctlQ8BH73 383 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ctdsp2Q8BX07 270 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arel1Q8CHG5 823 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ak6Q8VCP8 172 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FcrlaQ920A9 352 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Marc1Q9CW42 340 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp84Q9D654 559 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GhrlQ9EQX0 117 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gtf2h2Q9JIB4 396 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1040A2ARY1 313 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Alkal1J3QPP8 127 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm6401L7N2C0 213 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gp1baO35930 734 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fabp3P11404 133 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tigd2Q0VBL1 525 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Samd12Q0VE29 161 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccser2Q3UHI0 833 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clec4a4Q5YIR8 236 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd6Q61003 665 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stard3Q61542 446 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1197Q7TR13 314 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1196Q7TR14 314 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dcaf12l1Q8CBW4 501 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr659Q8VGV6 322 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AmotQ8VHG2 1126 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ndufs1Q91VD9 727 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mdm1Q9D067 708 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myg1Q9JK81 380 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm29106A0A087WSP8 697 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Skint7A7XV04 395 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wsb2O54929 404 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cldn2O88552 230 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Etv2P41163 335 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smad5P97454 465 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fut7Q11131 389 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pyroxd2Q3U4I7 581 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CilpQ66K08 1184 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptx4Q6RUU0 478 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myl12aQ6ZWQ9 172 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vwa2Q70UZ7 791 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Coq4Q8BGB8 266 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rgs7bpQ8BQP9 257 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sit1Q8C503 180 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r84Q8R284 318 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr448Q8VES9 310 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr690Q8VH18 315 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2j9Q924D1 502 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smurf1Q9CUN6 731 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mkrn2Q9ERV1 416 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spint1Q9R097 507 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slfn3A0A1L1STQ7 640 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr171G5E8J1 314 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r10K7N621 847 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sap18O55128 153 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cst3P21460 140 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc26a1P58735 704 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Irf7P70434 457 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem184cQ3TPR7 525 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 A630001G21RikQ3UTB2 229 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arnt2Q61324 712 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbm45Q8BHN5 476 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 B430218F22RikQ8BQR5 223 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Oas1hQ8VI97 369 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 L2hgdhQ91YP0 464 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aar2Q9D2V5 384 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdc20Q9JJ66 499 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acss2Q9QXG4 701 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wdr54Q9R0D8 334 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim12cD3Z3L3 497 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm17555F6U8B9 371 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm17174M0QWQ9 212 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Suv39h1O54864 412 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HmbsP22907 361 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GcgP55095 180 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Alox12eP55249 662 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PtprcapQ64697 197 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rapgefl1Q68EF8 662 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zc3hav1lQ8BFR1 296 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem184bQ8BG09 407 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tspan12Q8BKT6 305 aa15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54.3 ms